登録情報 | データベース: PDB / ID: 5em2 |
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タイトル | Crystal structure of the Erb1-Ytm1 complex |
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要素 | - Ribosome biogenesis protein ERB1
- Ribosome biogenesis protein YTM1
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キーワード | RIBOSOME / ribosome biogenesis / complex / WD40 / transcription |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
PeBoW complex / maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / preribosome, large subunit precursor / ribonucleoprotein complex binding / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / nucleoplasm類似検索 - 分子機能 WD repeat WDR12/Ytm1 / BOP1, N-terminal domain / WD repeat BOP1/Erb1 / BOP1NT (NUC169) domain / BOP1NT (NUC169) domain / NLE / NLE (NUC135) domain / YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase / 7 Propeller / Methylamine Dehydrogenase; Chain H ...WD repeat WDR12/Ytm1 / BOP1, N-terminal domain / WD repeat BOP1/Erb1 / BOP1NT (NUC169) domain / BOP1NT (NUC169) domain / NLE / NLE (NUC135) domain / YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase / 7 Propeller / Methylamine Dehydrogenase; Chain H / G-protein beta WD-40 repeat / WD40 repeat, conserved site / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Ribosome biogenesis protein ERB1 / Ribosome biogenesis protein YTM1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Chaetomium thermophilum (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.67 Å |
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データ登録者 | Ahmed, Y.L. / Sinning, I. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2016 タイトル: Concerted removal of the Erb1-Ytm1 complex in ribosome biogenesis relies on an elaborate interface. 著者: Thoms, M. / Ahmed, Y.L. / Maddi, K. / Hurt, E. / Sinning, I. |
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履歴 | 登録 | 2015年11月5日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2015年12月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年2月10日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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