[English] 日本語
Yorodumi- PDB-5dg3: Structure of Pseudomonas aeruginosa LpxA in complex with UDP-3-O-... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5dg3 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Structure of Pseudomonas aeruginosa LpxA in complex with UDP-3-O-(R-3-hydroxydecanoyl)-GlcNAc | ||||||
Components | Acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / Acyltransferases / Catalytic Domain / UDP-GlcNAc / Fatty Acids / Lipid A / Substrate Specificity / Uridine Diphosphate N-Acetylglucosamine / Hydrocarbon Rulers | ||||||
Function / homology | Function and homology information acyl-[acyl-carrier-protein]-UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase / acyl-[acyl-carrier-protein]-UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase activity / lipid A biosynthetic process / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Pseudomonas aeruginosa (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.3 Å | ||||||
Authors | Smith, E.W. / Chen, Y. | ||||||
Citation | Journal: Biochemistry / Year: 2015 Title: Structures of Pseudomonas aeruginosa LpxA Reveal the Basis for Its Substrate Selectivity. Authors: Smith, E.W. / Zhang, X. / Behzadi, C. / Andrews, L.D. / Cohen, F. / Chen, Y. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5dg3.cif.gz | 302.5 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb5dg3.ent.gz | 245.3 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5dg3.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dg/5dg3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dg/5dg3 | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1 / Refine code: 1
|