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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5c9p
タイトル
Crystal structure of recombinant PLL lectin complexed with L-fucose from Photorhabdus luminescens at 1.75 A resolution
要素
PLL lectin
キーワード
SUGAR BINDING PROTEIN / Lectin / seven-bladed beta-propeller / fucose-specific
機能・相同性
Protein of unknown function DUF346 / Repeat of unknown function (DUF346) / metal ion binding / alpha-L-fucopyranose / Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1 complete genome segment 3/17
解像度: 1.75→39.1 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.97 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.957 / SU B: 1.786 / SU ML: 0.055 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.076 / ESU R Free: 0.083 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.18111
2608
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1417
-
-
-
obs
0.14363
48756
99.96 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK