登録情報 | データベース: PDB / ID: 5b42 |
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タイトル | Crystal structure of the C-terminal endonuclease domain of Aquifex aeolicus MutL. |
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要素 | DNA mismatch repair protein MutL |
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN / mismatch repair / endonuclease / cadmium |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
mismatch repair complex / mismatched DNA binding / ATP-dependent DNA damage sensor activity / mismatch repair / ATP hydrolysis activity / ATP binding類似検索 - 分子機能 MutL, C-terminal domain, dimerisation subdomain / DNA mismatch repair protein, MutL / formyl-coa transferase, domain 3 / MutL, C-terminal, dimerisation / MutL, C-terminal domain superfamily / MutL, C-terminal domain, dimerisation subdomain / MutL C terminal dimerisation domain / DNA mismatch repair protein family, N-terminal / DNA mismatch repair protein, S5 domain 2-like / DNA mismatch repair, conserved site ...MutL, C-terminal domain, dimerisation subdomain / DNA mismatch repair protein, MutL / formyl-coa transferase, domain 3 / MutL, C-terminal, dimerisation / MutL, C-terminal domain superfamily / MutL, C-terminal domain, dimerisation subdomain / MutL C terminal dimerisation domain / DNA mismatch repair protein family, N-terminal / DNA mismatch repair protein, S5 domain 2-like / DNA mismatch repair, conserved site / DNA mismatch repair protein MutL/Mlh/Pms / DNA mismatch repair protein, C-terminal domain / DNA mismatch repair proteins mutL / hexB / PMS1 signature. / DNA mismatch repair protein, C-terminal domain / Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase / Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 : / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / DNA mismatch repair protein MutL類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Aquifex aeolicus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 1.35 Å |
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データ登録者 | Fukui, K. / Baba, S. / Kumasaka, T. / Yano, T. |
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資金援助 | 日本, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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the Ministry of Education, Science, Sports and Culture of Japan | 26850050 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2016 タイトル: Structural Features and Functional Dependency on beta-Clamp Define Distinct Subfamilies of Bacterial Mismatch Repair Endonuclease MutL 著者: Fukui, K. / Baba, S. / Kumasaka, T. / Yano, T. |
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履歴 | 登録 | 2016年3月30日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2016年7月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年9月7日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2020年2月26日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / diffrn_source / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.3 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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