登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ao7 |
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タイトル | Crystal Structure of SltB3 from Pseudomonas aeruginosa in complex with NAG-anhNAM-pentapeptide |
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要素 | SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B3 |
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キーワード | TRANSFERASE / LYTIC TRANSGLYCOSILASE / CELL WALL RECYCLING |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
lytic transglycosylase activity / peptidoglycan turnover / peptidoglycan catabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Lytic murein transglycosylase / Transglycosylase SLT domain 2 / Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like / Transglycosylase SLT domain / PGBD superfamily / Peptidoglycan binding-like / Putative peptidoglycan binding domain / PGBD-like superfamily / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Lysozyme-like domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-AH0 / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Lytic murein transglycosylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) PSEUDOMONAS AERUGINOSA (緑膿菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.09 Å |
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データ登録者 | Dominguez-Gil, T. / Hermoso, J.A. |
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引用 | ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2016 タイトル: Turnover of Bacterial Cell Wall by Sltb3, a Multidomain Lytic Transglycosylase of Pseudomonas Aeruginosa. 著者: Lee, M. / Dominguez-Gil, T. / Hesek, D. / Mahasenan, K.V. / Lastochkin, E. / Hermoso, J.A. / Mobashery, S. |
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履歴 | 登録 | 2015年9月9日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年7月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年7月27日 | Group: Other / Refinement description |
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改定 2.0 | 2018年6月20日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / database_PDB_caveat ...atom_site / database_PDB_caveat / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_conn_type Item: _atom_site.occupancy / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id ..._atom_site.occupancy / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn_type.id |
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改定 2.1 | 2018年8月22日 | Group: Data collection / カテゴリ: reflns / reflns_shell Item: _reflns.pdbx_CC_half / _reflns_shell.d_res_high ..._reflns.pdbx_CC_half / _reflns_shell.d_res_high / _reflns_shell.d_res_low / _reflns_shell.pdbx_CC_half |
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改定 2.2 | 2020年7月29日 | Group: Data collection / Derived calculations ...Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.3 | 2024年1月10日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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