[English] 日本語
Yorodumi- PDB-5akd: MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 3 -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5akd | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 3 | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | DNA BINDING PROTEIN / DNA MISMATCH REPAIR / COMPLEX / SLIDING CLAMP / CROSSLINKING | ||||||
Function / homology | Function and homology information single-stranded DNA-dependent ATP-dependent DNA helicase complex / mismatch repair involved in maintenance of fidelity involved in DNA-dependent DNA replication / adenine/cytosine mispair binding / MutS complex / mismatch repair complex / regulation of DNA recombination / nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding / mismatched DNA binding / DNA binding, bending / ATP-dependent DNA damage sensor activity ...single-stranded DNA-dependent ATP-dependent DNA helicase complex / mismatch repair involved in maintenance of fidelity involved in DNA-dependent DNA replication / adenine/cytosine mispair binding / MutS complex / mismatch repair complex / regulation of DNA recombination / nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding / mismatched DNA binding / DNA binding, bending / ATP-dependent DNA damage sensor activity / mismatch repair / ADP binding / damaged DNA binding / DNA damage response / ATP hydrolysis activity / DNA binding / ATP binding / identical protein binding / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ESCHERICHIA COLI (E. coli) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 7.6 Å | ||||||
Authors | Groothuizen, F.S. / Winkler, I. / Cristovao, M. / Fish, A. / Winterwerp, H.H.K. / Reumer, A. / Marx, A.D. / Hermans, N. / Nicholls, R.A. / Murshudov, G.N. ...Groothuizen, F.S. / Winkler, I. / Cristovao, M. / Fish, A. / Winterwerp, H.H.K. / Reumer, A. / Marx, A.D. / Hermans, N. / Nicholls, R.A. / Murshudov, G.N. / Lebbink, J.H.G. / Friedhoff, P. / Sixma, T.K. | ||||||
Citation | Journal: Elife / Year: 2015 Title: MutS/MutL crystal structure reveals that the MutS sliding clamp loads MutL onto DNA. Authors: Groothuizen, F.S. / Winkler, I. / Cristovao, M. / Fish, A. / Winterwerp, H.H. / Reumer, A. / Marx, A.D. / Hermans, N. / Nicholls, R.A. / Murshudov, G.N. / Lebbink, J.H. / Friedhoff, P. / Sixma, T.K. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5akd.cif.gz | 2.3 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb5akd.ent.gz | 1.9 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5akd.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5akd_validation.pdf.gz | 1.7 MB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 5akd_full_validation.pdf.gz | 1.9 MB | Display | |
Data in XML | 5akd_validation.xml.gz | 198.8 KB | Display | |
Data in CIF | 5akd_validation.cif.gz | 261 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ak/5akd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ak/5akd | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 5akbC 5akcC 1bknS 1w7aS C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
|