- PDB-5acy: N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1-(2R,4S)-2-methyl-4-(p... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5acy
タイトル
N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1-(2R,4S)-2-methyl-4-(phenylamino)-6-4-(piperidin-1-ylmethyl)phenyl-1,2,3,4- tetrahydroquinolin-1-yl-ethan-1-one
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.984 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.01→36.01 Å / Num. obs: 18016 / % possible obs: 97 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.7 % / Rmerge(I) obs: 0.08 / Net I/σ(I): 8.1
反射 シェル
解像度: 2.01→2.13 Å / 冗長度: 2.8 % / Rmerge(I) obs: 0.35 / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / % possible all: 98.2
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0073
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: NONE 解像度: 2.01→33.23 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.944 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.914 / SU B: 5.538 / SU ML: 0.151 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.056 / ESU R Free: 0.046 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.27081
894
5 %
RANDOM
Rwork
0.21126
-
-
-
obs
0.21425
17095
96.03 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK