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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4zy9
タイトル
X-ray crystal structure of selenomethionine-labelled V110M mutant of chitosan-binding module 1 derived from chitosanase/glucanase from Paenibacillus sp. IK-5
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97865 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.2→50 Å / Num. obs: 78378 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 6.1 % / Net I/σ(I): 28.4
反射 シェル
解像度: 1.2→1.22 Å / 冗長度: 4.1 % / Rmerge(I) obs: 0.222 / Mean I/σ(I) obs: 4.5 / % possible all: 97
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0049
精密化
HKL-2000
データスケーリング
PHENIX
位相決定
Coot
モデル構築
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.2→47.55 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.949 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.921 / SU B: 0.846 / SU ML: 0.04 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.052 / ESU R Free: 0.058 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.24921
1994
2.6 %
RANDOM
Rwork
0.2083
-
-
-
obs
0.20934
75932
99.15 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK