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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4zy8 | ||||||
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タイトル | K. lactis Lst4 longin domain | ||||||
![]() | Protein LST4 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / longin / DENN | ||||||
機能・相同性 | ![]() FNIP-folliculin RagC/D GAP / vacuolar membrane / amino acid transport / positive regulation of TORC1 signaling / GTPase activator activity / protein transport 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Pacitto, A. / Ascher, D.B. / Blundell, T.L. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Lst4, the yeast Fnip1/2 orthologue, is a DENN-family protein. 著者: Pacitto, A. / Ascher, D.B. / Wong, L.H. / Blaszczyk, B.K. / Nookala, R.K. / Zhang, N. / Dokudovskaya, S. / Levine, T.P. / Blundell, T.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 127 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 97.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20640.516 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 58-226 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.22 % |
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結晶化 | 温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.8 / 詳細: Sodium chloride, Butan-1-ol, Bis-Tris |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: PSI PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年8月12日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.979 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.14→35.29 Å / Num. obs: 38603 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 12.1 % / Rmerge(I) obs: 0.066 / Net I/σ(I): 20.4 |
反射 シェル | 解像度: 2.14→2.216 Å / 冗長度: 11.9 % / Rmerge(I) obs: 0.632 / Mean I/σ(I) obs: 4.4 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.14→35.29 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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