PDB-4zbf: Mcl-1 complexed with small molecules

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4zbf

タイトル

Mcl-1 complexed with small molecules

要素

Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

キーワード

apoptosis/apoptosis inhibitor / Inhibitor / Complex / apoptosis-apoptosis inhibitor complex

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway / cell fate determination / cellular homeostasis / mitochondrial fusion / Bcl-2 family protein complex / BH3 domain binding / negative regulation of anoikis / protein transmembrane transporter activity / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / response to cytokine ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

Zhao, B.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2015
タイトル: Discovery of tricyclic indoles that potently inhibit mcl-1 using fragment-based methods and structure-based design.
著者: Burke, J.P. / Bian, Z. / Shaw, S. / Zhao, B. / Goodwin, C.M. / Belmar, J. / Browning, C.F. / Vigil, D. / Friberg, A. / Camper, D.V. / Rossanese, O.W. / Lee, T. / Olejniczak, E.T. / Fesik, S.W.

履歴

登録	2015年4月14日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2015年4月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年5月27日	Group: Database references
改定 1.2	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / Database references ...Author supporting evidence / Database references / Derived calculations / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: citation / entity_src_gen ...citation / entity_src_gen / pdbx_audit_support / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list / struct_keywords Item: _citation.journal_id_CSD / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag ..._citation.journal_id_CSD / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_keywords.text
改定 1.3	2019年12月4日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2024年3月6日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	4zbf_full_validation.pdf.gz	4.1 MB	表示
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CIF形式データ	4zbf_validation.cif.gz	92 KB	表示
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関連構造データ

関連構造データ	4zbiC 4hw2 C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6qzb-d 6oqn-1 6qz5-d 4rdo-2 4zbi-5 4oq5-2 5if4-1 4qnq-7 4r0s-1 4hw3-4 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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登録構造単位

A: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

B: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

C: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

D: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

E: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

F: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

G: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

H: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

I: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

J: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

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L: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

ヘテロ分子

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1

A: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

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2

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3

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5

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6

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7

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8

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10

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11

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12

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13

L: Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1

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単位格子

Length a, b, c (Å)	62.722, 134.405, 135.332
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 100.27, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1 / Bcl-2-like protein 3 / Bcl2-L-3 / Bcl-2-related protein EAT/mcl1 / mcl1/EAT 分子量: 17850.281 Da / 分子数: 12 / 断片: unp residues 172-327 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MCL1, BCL2L3 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q07820
#2: 化合物	ChemComp-4M7 / (1R)-7-[3-(naphthalen-1-yloxy)propyl]-3,4-dihydro-2H-[1,4]thiazepino[2,3,4-hi]indole-6-carboxylic acid 1-oxide 分子量: 433.519 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₅H₂₃NO₄S
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 347 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.62 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.06 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸発脱水法 / 詳細: PEG 3350, magnesium chloride, Bis-Tris / PH範囲: 6.0 - 8.0

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 21-ID-G / 波長: 0.97856 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2012年8月10日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97856 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→50 Å / Num. obs: 108388 / % possible obs: 96.6 % / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.049 / R_sym value: 0.041 / Net I/av σ(I): 25.6 / Net I/σ(I): 29.8
反射シェル	解像度: 2.2→2.24 Å / 冗長度: 2.6 % / R_merge(I) obs: 0.35 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / % possible all: 91.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	dev_1951	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.2→29.998 Å / SU ML: 0.29 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.41 / 位相誤差: 23.97 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2316	2017	1.87 %
R_work	0.1827	-	-
obs	0.1836	107925	96.6 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.2→29.998 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14470	0	372	347	15189

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	15127
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.333	20375
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	17.564	5637
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.066	2217
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.008	2566

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.2-2.255	0.337	153	0.2819	7175	X-RAY DIFFRACTION	92
2.255-2.316	0.3029	136	0.2572	7253	X-RAY DIFFRACTION	93
2.316-2.3841	0.2926	140	0.2369	7356	X-RAY DIFFRACTION	94
2.3841-2.461	0.277	139	0.2246	7328	X-RAY DIFFRACTION	94
2.461-2.5489	0.2812	143	0.2225	7443	X-RAY DIFFRACTION	95
2.5489-2.6509	0.298	134	0.2124	7544	X-RAY DIFFRACTION	96
2.6509-2.7715	0.251	140	0.2123	7501	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7715-2.9175	0.2645	141	0.2152	7638	X-RAY DIFFRACTION	97
2.9175-3.1001	0.2781	151	0.2164	7683	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1001-3.3392	0.2515	141	0.2005	7707	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3392-3.6747	0.2457	153	0.195	7789	X-RAY DIFFRACTION	99
3.6747-4.2052	0.202	146	0.1576	7814	X-RAY DIFFRACTION	99
4.2052-5.2933	0.1976	151	0.1429	7824	X-RAY DIFFRACTION	100
5.2933-30.0004	0.1731	149	0.1423	7853	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.5195	1.0964	0.7726	2.0377	1.0114	1.7011	-0.1013	-0.0237	-0.1282	0.1141	0.2459	-0.3064	-0.1282	0.1619	-0.0353	0.3529	0.0147	0.0035	0.3302	-0.0558	0.2891	-26.3977	11.1773	-9.0341
2	0.8857	-0.4103	-0.2457	1.8883	0.8929	1.7989	0.0292	0.0506	0.1692	-0.0521	0.0981	-0.557	-0.1536	0.3292	-0.0361	0.3827	-0.0427	0.0462	0.4245	-0.0713	0.4335	-21.6406	16.8818	-13.862
3	2.7596	0.7724	-1.5793	4.8337	-2.1593	6.0255	-0.0887	-0.4458	0.5154	0.7391	0.2731	-0.4769	-0.6905	0.1141	0.0129	0.5139	-0.1161	0.0324	0.5452	-0.1442	0.3815	-23.4212	28.4414	5.543
4	3.0508	-0.4822	0.9204	1.8554	-0.3769	1.7595	0.1274	-0.4468	0.0871	0.0864	-0.1285	-0.2299	0.3739	0.063	-0.0326	0.5865	0.0446	-0.0696	0.4423	-0.07	0.3411	-29.7364	16.819	8.2168
5	2.0593	0.8811	0.4354	2.133	-0.1228	2.7957	-0.0073	-0.1923	-0.0627	0.2763	0.0971	-0.1084	-0.1207	0.2166	-0.0057	0.3841	0.011	0.0018	0.3425	-0.0991	0.3008	-27.1661	17.9313	-0.981
6	3.0204	0.3717	-0.1751	2.7287	-0.2374	1.572	-0.1041	0.4656	0.126	-0.4703	0.1344	-0.0541	-0.2742	-0.1391	-0.0254	0.4301	0.034	0.0093	0.3196	-0.0384	0.3196	-35.4784	20.3784	-16.5885
7	1.5143	-0.2801	0.2164	2.8122	-1.119	2.0921	0.2032	0.2596	-0.2268	-0.3339	-0.3895	0.157	0.1068	-0.0485	-0.0572	0.3311	-0.0221	0.0056	0.4017	-0.0968	0.2955	-21.5593	-3.5142	-38.3569
8	0.1756	0.3081	-0.4284	0.5225	-0.6075	1.3777	-0.3516	0.0036	0.1719	0.2406	-0.0242	0.3434	0.2902	0.0733	-0.0788	0.7959	-0.0092	-0.1745	0.6603	-0.0795	0.5976	-29.7781	-7.2597	-40.9442
9	2.2267	0.6027	-0.1759	3.9722	-0.4378	2.2161	-0.1926	0.0066	0.2713	-0.1226	0.316	0.5755	-0.3789	-0.6368	-0.0763	0.3494	0.0079	-0.0179	0.4985	-0.1102	0.363	-28.7062	5.4311	-34.8719
10	6.8185	-2.2594	-2.6664	4.0459	1.9878	1.8332	0.4147	0.3658	0.711	-0.4114	-0.3121	0.0773	-0.9488	0.0565	-0.0584	0.5932	-0.0091	0.0145	0.3923	-0.0045	0.454	-14.5294	17.409	-44.4096
11	1.3374	-0.173	0.0591	1.304	0.39	4.427	-0.0773	0.2606	-0.0014	-0.3362	-0.0744	-0.3419	-0.2079	0.375	-0.028	0.4563	-0.0975	0.1166	0.3956	-0.0313	0.394	-7.2579	6.2426	-44.9448
12	2.0043	-0.4674	-0.642	1.8736	-0.5592	3.3359	0.0798	0.1761	0.0978	-0.3128	-0.0387	-0.1653	-0.195	0.2216	-0.004	0.3475	-0.0529	0.0305	0.3323	-0.0615	0.2908	-15.4618	4.2114	-38.3094
13	3.8015	-1.343	-0.0194	2.7527	0.6906	1.1713	-0.1247	-0.8662	0.0814	0.2238	-0.0594	0.3234	0.0887	-0.0267	-0.0091	0.2915	-0.0149	0.0217	0.4161	-0.093	0.3226	-25.6767	2.4754	-24.749
14	1.3598	0.5168	0.657	2.6865	1.5583	2.7915	0.0716	0.0221	0.2096	-0.0191	-0.198	0.2515	-0.2375	-0.6175	0.0927	0.3753	0.1202	-0.0518	0.3958	-0.0654	0.3686	-6.8668	14.3056	-68.9731
15	0.009	0.047	-0.0129	0.3234	0.0091	0.0116	-0.1936	0.1054	0.2632	-0.1728	-0.1115	0.8245	-0.5974	-0.0781	0.0436	0.5379	0.2072	-0.0394	0.9594	-0.0939	0.7982	-16.9645	14.2795	-72.6039
16	1.0462	0.366	-0.0837	1.3415	-0.6168	2.1457	-0.1287	0.2745	0.0282	-0.4656	-0.059	0.0122	0.055	-0.4627	-0.014	0.3811	0.0436	-0.0398	0.4121	-0.0144	0.3428	-2.4963	7.5562	-80.3489
17	0.9051	-0.5367	0.968	2.2441	0.6291	2.1302	-0.0846	-0.09	-0.1971	-0.0067	-0.1415	-0.1533	0.0765	-0.2308	-0.0067	0.3414	0.009	0.0485	0.3272	-0.0074	0.3589	1.3068	2.6561	-71.3664
18	3.019	2.5912	-0.2674	5.0716	-0.2663	1.86	0.2404	-0.2836	0.152	0.4148	-0.2903	0.1145	-0.3859	-0.2688	-0.0035	0.3829	0.0316	-0.0223	0.3178	-0.018	0.3478	1.3958	11.9038	-66.7459
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61	3.4544	0.2646	-0.5833	2.8219	0.5949	4.0825	-0.5262	-1.3969	0.5962	0.8342	0.6128	-0.4317	-0.3494	0.3606	-0.048	0.5765	0.163	-0.1089	0.6889	-0.2729	0.449	-12.773	2.8967	-88.2383
62	3.2314	-0.7607	0.0612	2.7566	-0.2368	1.9715	0.1896	-0.0521	0.3955	-0.5769	-0.0304	0.1661	0.288	-0.1483	-0.0186	0.4044	-0.0003	-0.0807	0.4788	0.0032	0.4245	-9.7129	1.3523	-101.2277
63	1.6565	-0.9861	0.0319	2.5077	-0.2807	1.792	-0.4472	-0.1277	0.1153	0.5868	0.0473	0.1535	0.431	0.2608	-0.013	0.4586	0.093	-0.0472	0.5334	-0.0138	0.3407	-12.9801	-6.8848	-92.7097
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82	3.0478	0.9462	-0.9577	4.1986	-1.4578	2.8497	0.0104	-0.2628	0.0388	0.6311	-0.1645	0.085	-0.0683	0.1502	-0.0471	0.6186	0.0597	0.0232	0.4066	-0.0183	0.4464	-25.8239	-17.0572	15.2509
83	2.4495	1.6767	0.69	1.4163	0.1457	5.3958	-0.6647	-0.6317	-0.8838	0.4656	-0.0914	0.1472	0.9061	0.5706	0.0063	0.962	0.1394	0.1736	0.3893	0.1268	0.5661	-21.5742	-33.381	14.7088

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
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2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 191 through 223 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 224 through 235 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 236 through 254 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 255 through 301 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 302 through 323 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 171 through 190 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 191 through 202 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 203 through 223 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 224 through 235 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 236 through 254 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 255 through 308 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 309 through 321 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 171 through 190 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 191 through 203 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 204 through 235 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 236 through 283 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 284 through 308 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 309 through 322 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 171 through 191 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 192 through 223 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 224 through 235 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 236 through 280 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 281 through 301 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 302 through 321 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 171 through 191 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 192 through 202 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 203 through 223 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 224 through 254 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 255 through 301 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 302 through 310 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 311 through 321 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 171 through 191 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 192 through 223 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 224 through 235 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 236 through 254 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 255 through 283 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 284 through 308 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 309 through 321 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 171 through 191 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 192 through 223 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'G' and (resid 224 through 246 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'G' and (resid 247 through 254 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'G' and (resid 255 through 301 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'G' and (resid 302 through 321 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resid 171 through 191 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resid 192 through 202 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'H' and (resid 203 through 223 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'H' and (resid 224 through 246 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'H' and (resid 247 through 281 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'H' and (resid 282 through 301 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'H' and (resid 302 through 321 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'I' and (resid 171 through 190 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'I' and (resid 191 through 202 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'I' and (resid 203 through 260 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'I' and (resid 261 through 301 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'I' and (resid 302 through 321 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'J' and (resid 171 through 190 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'J' and (resid 191 through 203 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'J' and (resid 204 through 223 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'J' and (resid 224 through 235 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'J' and (resid 236 through 254 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'J' and (resid 255 through 280 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 281 through 301 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'J' and (resid 302 through 310 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'J' and (resid 311 through 321 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'K' and (resid 171 through 191 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'K' and (resid 192 through 202 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'K' and (resid 203 through 223 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'K' and (resid 224 through 235 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'K' and (resid 236 through 246 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'K' and (resid 247 through 254 )
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'K' and (resid 255 through 280 )
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'K' and (resid 281 through 301 )
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'K' and (resid 302 through 321 )
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'L' and (resid 171 through 190 )
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'L' and (resid 191 through 202 )
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'L' and (resid 203 through 223 )
79	X-RAY DIFFRACTION	79	chain 'L' and (resid 224 through 235 )
80	X-RAY DIFFRACTION	80	chain 'L' and (resid 236 through 254 )
81	X-RAY DIFFRACTION	81	chain 'L' and (resid 255 through 283 )
82	X-RAY DIFFRACTION	82	chain 'L' and (resid 284 through 308 )
83	X-RAY DIFFRACTION	83	chain 'L' and (resid 309 through 321 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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