温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: Initial screening of 0.3 microl 14 mg/ml A. niger Fdc1 in 100 mM NaCl, 25 mM Tris pH 7.5 and 0.3 microl reservoir solution at 4C resulted in a number of hits including PACT condition F4 ...詳細: Initial screening of 0.3 microl 14 mg/ml A. niger Fdc1 in 100 mM NaCl, 25 mM Tris pH 7.5 and 0.3 microl reservoir solution at 4C resulted in a number of hits including PACT condition F4 (molecular dimensions). Seed stock produced from these crystals was used in an optimization screen based around 0.2 M potassium thiocyanate, Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 mixing 0.05 microl seed stock, 0.25 microl protein solution and 0.3 microl reservoir solution at 4C.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.987 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.22→33.82 Å / Num. obs: 152260 / % possible obs: 99.96 % / 冗長度: 6.1 % / Rpim(I) all: 0.037 / Net I/σ(I): 11.2
反射 シェル
解像度: 1.22→1.25 Å / 冗長度: 5.8 % / Mean I/σ(I) obs: 2 / Rpim(I) all: 0.354 / % possible all: 99.99
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.5.0102
精密化
xia2
データ削減
xia2
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.22→33.82 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.971 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.966 / SU B: 1.226 / SU ML: 0.025 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.037 / ESU R Free: 0.035 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.16111
8041
5 %
RANDOM
Rwork
0.14573
-
-
-
obs
0.14652
152260
99.96 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK