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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4ylh | ||||||
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タイトル | Crystal structure of DpgC with bound substrate analog and Xe on oxygen diffusion pathway | ||||||
要素 | DpgC | ||||||
キーワード | HYDROLASE / Dioxygenase / Xe complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 (3,5-dihydroxyphenyl)acetyl-CoA 1,2-dioxygenase / enoyl-CoA hydratase activity / oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen / fatty acid beta-oxidation / antibiotic biosynthetic process / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Streptomyces toyocaensis (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.58 Å | ||||||
データ登録者 | Li, K. / Di Russo, N.V. / Condurso, H.L. / Roitberg, A.E. / Bruner, S.D. | ||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: Chem Sci / 年: 2015 タイトル: Oxygen diffusion pathways in a cofactor-independent dioxygenase. 著者: Di Russo, N.V. / Condurso, H.L. / Li, K. / Bruner, S.D. / Roitberg, A.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 4ylh.cif.gz | 987.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb4ylh.ent.gz | 816.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 4ylh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 4ylh_validation.pdf.gz | 2.8 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 4ylh_full_validation.pdf.gz | 2.9 MB | 表示 | |
XML形式データ | 4ylh_validation.xml.gz | 183.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 4ylh_validation.cif.gz | 243.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yl/4ylh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yl/4ylh | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 2npgS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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