登録情報 | データベース: PDB / ID: 4yec |
---|
タイトル | Crystal structure of a clostripain (PARMER_00083) from Parabacteroides merdae ATCC 43184 in complex with peptide inhibitor Ac-VLTK-AOMK |
---|
要素 | - (Clostripain family) x 2
- Peptide inhibitor Ac-VLTK-AOMK
|
---|
キーワード | Unknown Function/Inhibitor / clostripain / microbiome / secreted protease / inhibitor / Unknown Function-Inhibitor complex |
---|
機能・相同性 | Rossmann fold - #11970 / Peptidase C11, clostripain / Clostripain family / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / Peptide inhibitor Ac-VLTK-AOMK / Clostripain family 機能・相同性情報 |
---|
生物種 | Parabacteroides merdae ATCC 43184 (バクテリア) unidentified (未定義) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.12 Å |
---|
データ登録者 | Wolan, D.W. / Gonzalez-Paez, G.E. / Chatterjee, S. |
---|
資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
---|
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | 3U54GM094586-03S1 | 米国 |
|
---|
引用 | ジャーナル: ACS Chem. Biol. / 年: 2017 タイトル: Substrate Profiling and High Resolution Co-complex Crystal Structure of a Secreted C11 Protease Conserved across Commensal Bacteria. 著者: Roncase, E.J. / Moon, C. / Chatterjee, S. / Gonzalez-Paez, G.E. / Craik, C.S. / O'Donoghue, A.J. / Wolan, D.W. |
---|
履歴 | 登録 | 2015年2月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2016年3月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2017年7月12日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
---|
改定 1.2 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
---|
改定 1.3 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
---|
改定 1.4 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_close_contact / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id |
---|
|
---|