登録情報 データベース : PDB / ID : 4ycp 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル E. coli dihydrouridine synthase C (DusC) in complex with tRNATrp 要素tRNA-dihydrouridine synthase C tRNATrp 詳細キーワード Oxidoreductase/RNA / tRNA modification / oxidoreductase-RNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
tRNA-dihydrouridine16 synthase activity / tRNA dihydrouridine synthesis / tRNA dihydrouridine synthase activity / 酸化還元酵素; CH-CH結合に対し酸化酵素として働く; NADまたはNADPを用いる / FMN binding / flavin adenine dinucleotide binding / tRNA binding 類似検索 - 分子機能 Dihydrouridine synthase, C-terminal recognition domain / tRNA-dihydrouridine(16) synthase / tRNA-dihydrouridine(16) synthase, C-terminal / tRNA-dihydrouridine synthase / Bacteriocin As-48; Chain A / tRNA-dihydrouridine synthase, conserved site / DUS-like, FMN-binding domain / Dihydrouridine synthase (Dus) / Uncharacterized protein family UPF0034 signature. / Aldolase class I ... Dihydrouridine synthase, C-terminal recognition domain / tRNA-dihydrouridine(16) synthase / tRNA-dihydrouridine(16) synthase, C-terminal / tRNA-dihydrouridine synthase / Bacteriocin As-48; Chain A / tRNA-dihydrouridine synthase, conserved site / DUS-like, FMN-binding domain / Dihydrouridine synthase (Dus) / Uncharacterized protein family UPF0034 signature. / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Up-down Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 FLAVIN MONONUCLEOTIDE / : / RNA / RNA (> 10) / tRNA-dihydrouridine(16) synthase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli K-12 (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.55 Å 詳細データ登録者 Byrne, R.T. / Jenkins, H.T. / Peters, D.T. / Whelan, F. / Stowell, J. / Aziz, N. / Kasatsky, P. / Rodnina, M.V. / Koonin, E.V. / Konevega, A.L. / Antson, A.A. 資金援助 英国, ロシア, 3件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Wellcome Trust 098230 英国 RFBR 13-04-40212-H comfi ロシア RSF 14-34-00023 ロシア
引用ジャーナル : Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年 : 2015タイトル : Major reorientation of tRNA substrates defines specificity of dihydrouridine synthases.著者 : Byrne, R.T. / Jenkins, H.T. / Peters, D.T. / Whelan, F. / Stowell, J. / Aziz, N. / Kasatsky, P. / Rodnina, M.V. / Koonin, E.V. / Konevega, A.L. / Antson, A.A. 履歴 登録 2015年2月20日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2015年4月22日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2015年5月13日 Group : Database references改定 1.2 2015年5月20日 Group : Database references改定 1.3 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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