登録情報 | データベース: PDB / ID: 4xj3 |
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タイトル | Crystal structure of Vibrio cholerae DncV GTP bound form |
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要素 | Cyclic AMP-GMP synthase |
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キーワード | TRANSFERASE / Cyclic GMP-AMP synthase / Bacterial virulence / nucleotidyltransferase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
3',3'-cyclic GMP-AMP synthase activity / cyclic nucleotide biosynthetic process / negative regulation of chemotaxis / diguanylate cyclase activity / 転移酵素; リンを含む基を移すもの; 核酸を移すもの / defense response to virus / GTP binding / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / : / : / Cyclic GMP-AMP synthase DncV-like, nucleotidyltransferase domain / Cyclic GMP-AMP synthase, C-terminal domain類似検索 - ドメイン・相同性 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Cyclic GMP-AMP synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 (コレラ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Kato, K. / Ishii, R. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2015 タイトル: Structural Basis for the Catalytic Mechanism of DncV, Bacterial Homolog of Cyclic GMP-AMP Synthase 著者: Kato, K. / Ishii, R. / Hirano, S. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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履歴 | 登録 | 2015年1月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2015年4月29日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年5月20日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2020年2月5日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Source and taxonomy カテゴリ: citation / diffrn_source ...citation / diffrn_source / entity_src_gen / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ..._citation.journal_id_CSD / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.3 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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