登録情報 データベース : PDB / ID : 4x8d 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Ergothioneine-biosynthetic sulfoxide synthase EgtB in complex with N,N-dimethyl-histidine and gamma-glutamyl-cysteine 要素Sulfoxide synthase EgtB 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / sulfoxide synthase / ergothioneine biosynthesis / C-Lectin / DinB / non-heme Fe(II) enzyme機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
gamma-glutamyl hercynylcysteine S-oxide synthase / gamma-glutamyl hercynylcysteine sulfoxide synthase activity / monooxygenase activity / iron ion binding 類似検索 - 分子機能 Hercynine oxygenase, Actinobacteria / Ergothioneine biosynthesis protein EgtB / DinB-like domain / DinB superfamily / DinB/YfiT-like putative metalloenzymes / : / Sulfatase-modifying factor enzyme / Sulfatase-modifying factor enzyme 1 / Sulfatase-modifying factor enzyme superfamily / C-type lectin fold 類似検索 - ドメイン・相同性 GAMMA-GLUTAMYLCYSTEINE / N,N-dimethyl-L-histidine / : / Hercynine oxygenase 類似検索 - 構成要素生物種 Mycobacterium thermoresistibile ATCC 19527 (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.98 Å 詳細データ登録者 Vit, A. / Goncharenko, K.V. / Blankenfeldt, W. / Seebeck, F.P. 資金援助 スイス, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Swiss National Science Foundation 147005 スイス
引用ジャーナル : Angew.Chem.Int.Ed.Engl. / 年 : 2015タイトル : Structure of the Sulfoxide Synthase EgtB from the Ergothioneine Biosynthetic Pathway.著者 : Goncharenko, K.V. / Vit, A. / Blankenfeldt, W. / Seebeck, F.P. 履歴 登録 2014年12月10日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2015年1月28日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2015年2月25日 Group : Database references改定 2.0 2017年9月6日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Author supporting evidence / Derived calculations カテゴリ : atom_site / pdbx_audit_support ... atom_site / pdbx_audit_support / pdbx_distant_solvent_atoms / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_site_gen Item : _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_seq_id ... _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_distant_solvent_atoms.auth_seq_id / _pdbx_distant_solvent_atoms.neighbor_macromolecule_distance / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_site_gen.auth_seq_id / _struct_site_gen.symmetry 改定 2.1 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry 改定 2.2 2024年11月13日 Group : Structure summaryカテゴリ : pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
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