PDB-4we0: JC Polyomavirus VP1 five-fold pore mutant P223M

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4we0

タイトル

JC Polyomavirus VP1 five-fold pore mutant P223M

要素

Major capsid protein VP1

キーワード

VIRAL PROTEIN / beta-sandwich / jelly-roll / viral major capsid protein / five-fold pore

機能・相同性

機能・相同性情報

T=7 icosahedral viral capsid / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / virion attachment to host cell / host cell nucleus / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能

生物種

JC polyomavirus (JC ポリオーマウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.1 Å

データ登録者

Stroh, L.J. / Stehle, T.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2015
タイトル: Modulation of a Pore in the Capsid of JC Polyomavirus Reduces Infectivity and Prevents Exposure of the Minor Capsid Proteins.
著者: Nelson, C.D. / Stroh, L.J. / Gee, G.V. / O'Hara, B.A. / Stehle, T. / Atwood, W.J.

履歴

登録	2014年9月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2015年2月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年3月18日	Group: Database references
改定 1.2	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4we0.cif.gz	507.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4we0.ent.gz	421.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4we0.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/we/4we0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/we/4we0	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4wdyC 4wdzC 3nxgS 3nxd S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6y5z-d 4jce-d 4jcd-d 4x12-d 4x13-d 4x0y-d 4x16-d 4jcf-d 3nxd-d 4wdz-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#47 - 2003年11月シミアンウイルス40 (Simian Virus 40) 類似性 (4) #221 - 2018年5月ヒトパピローマウイルスとワクチン (Human Papillomavirus and Vaccines) 類似性 (1) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Major capsid protein VP1

B: Major capsid protein VP1

C: Major capsid protein VP1

D: Major capsid protein VP1

E: Major capsid protein VP1

ヘテロ分子

151 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	149.720, 95.630, 128.510
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 110.40, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 4

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	VAL	VAL	VAL	VAL	A	A	26 - 29	9 - 12
2	1	VAL	VAL	VAL	VAL	B	B	26 - 29	9 - 12
3	1	VAL	VAL	VAL	VAL	C	C	26 - 29	9 - 12
4	1	VAL	VAL	VAL	VAL	D	D	26 - 29	9 - 12
5	1	VAL	VAL	VAL	VAL	E	E	26 - 29	9 - 12
1	2	THR	THR	ASP	ASP	A	A	31 - 51	14 - 34
2	2	THR	THR	ASP	ASP	B	B	31 - 51	14 - 34
3	2	THR	THR	ASP	ASP	C	C	31 - 51	14 - 34
4	2	THR	THR	ASP	ASP	D	D	31 - 51	14 - 34
5	2	THR	THR	ASP	ASP	E	E	31 - 51	14 - 34
1	3	HIS	HIS	PHE	PHE	A	A	53 - 57	36 - 40
2	3	HIS	HIS	PHE	PHE	B	B	53 - 57	36 - 40
3	3	HIS	HIS	PHE	PHE	C	C	53 - 57	36 - 40
4	3	HIS	HIS	PHE	PHE	D	D	53 - 57	36 - 40
5	3	HIS	HIS	PHE	PHE	E	E	53 - 57	36 - 40
1	4	PRO	PRO	ILE	ILE	A	A	78 - 85	61 - 68
2	4	PRO	PRO	ILE	ILE	B	B	78 - 85	61 - 68
3	4	PRO	PRO	ILE	ILE	C	C	78 - 85	61 - 68
4	4	PRO	PRO	ILE	ILE	D	D	78 - 85	61 - 68
5	4	PRO	PRO	ILE	ILE	E	E	78 - 85	61 - 68
1	5	MET	MET	VAL	VAL	A	A	101 - 111	84 - 94
2	5	MET	MET	VAL	VAL	B	B	101 - 111	84 - 94
3	5	MET	MET	VAL	VAL	C	C	101 - 111	84 - 94
4	5	MET	MET	VAL	VAL	D	D	101 - 111	84 - 94
5	5	MET	MET	VAL	VAL	E	E	101 - 111	84 - 94
1	6	ALA	ALA	THR	THR	A	A	126 - 162	109 - 145
2	6	ALA	ALA	THR	THR	B	B	126 - 162	109 - 145
3	6	ALA	ALA	THR	THR	C	C	126 - 162	109 - 145
4	6	ALA	ALA	THR	THR	D	D	126 - 162	109 - 145
5	6	ALA	ALA	THR	THR	E	E	126 - 162	109 - 145
1	7	ASN	ASN	LEU	LEU	A	A	173 - 189	156 - 172
2	7	ASN	ASN	LEU	LEU	B	B	173 - 189	156 - 172
3	7	ASN	ASN	LEU	LEU	C	C	173 - 189	156 - 172
4	7	ASN	ASN	LEU	LEU	D	D	173 - 189	156 - 172
5	7	ASN	ASN	LEU	LEU	E	E	173 - 189	156 - 172
1	8	ALA	ALA	THR	THR	A	A	194 - 205	177 - 188
2	8	ALA	ALA	THR	THR	B	B	194 - 205	177 - 188
3	8	ALA	ALA	THR	THR	C	C	194 - 205	177 - 188
4	8	ALA	ALA	THR	THR	D	D	194 - 205	177 - 188
5	8	ALA	ALA	THR	THR	E	E	194 - 205	177 - 188
1	9	PHE	PHE	VAL	VAL	A	A	240 - 287	223 - 270
2	9	PHE	PHE	VAL	VAL	B	B	240 - 287	223 - 270
3	9	PHE	PHE	VAL	VAL	C	C	240 - 287	223 - 270
4	9	PHE	PHE	VAL	VAL	D	D	240 - 287	223 - 270
5	9	PHE	PHE	VAL	VAL	E	E	240 - 287	223 - 270
1	10	ILE	ILE	SER	SER	A	A	112 - 122	95 - 105
2	10	ILE	ILE	SER	SER	B	B	112 - 122	95 - 105
3	10	ILE	ILE	SER	SER	C	C	112 - 122	95 - 105
4	10	ILE	ILE	SER	SER	D	D	112 - 122	95 - 105
5	10	ILE	ILE	SER	SER	E	E	112 - 122	95 - 105

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(1), (1), (1)
2	given	(0.441507, 0.853742, 0.276038), (-0.855906, 0.308413, 0.415098), (0.269253, -0.419531, 0.866889)	11.33337, 20.28363, -5.69503
3	given	(-0.449732, 0.514494, 0.730094), (-0.528187, -0.812374, 0.247117), (0.72025, -0.27449, 0.637099)	31.66548, 14.62503, -15.68106
4	given	(-0.443381, -0.536085, 0.71835), (0.519955, -0.806636, -0.281043), (0.73011, 0.2489, 0.636387)	33.07141, -8.74875, -16.81253
5	given	(0.448001, -0.852805, 0.268362), (0.848497, 0.311, -0.428172), (0.281686, 0.419526, 0.862931)	13.58788, -18.00196, -6.96701

#1: タンパク質	Major capsid protein VP1 / Major structural protein VP1 分子量: 30109.939 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) JC polyomavirus (JC ポリオーマウイルス) プラスミド: pET15b / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P03089
#2: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 530 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.86 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.05 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 / 詳細: 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M KSCN, 12% PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年8月18日
放射	モノクロメーター: Bartels Monochromator / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.1→50 Å / Num. obs: 98969 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 3.8 % / B_iso Wilson estimate: 29.8 Å² / Net I/σ(I): 9.2
反射シェル	解像度: 2.1→2.15 Å / 冗長度: 3.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.7 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0049	精密化
XDS		データ削減
Coot		モデル構築
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3NXG

3nxg

解像度: 2.1→50 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.956 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.935 / SU B: 10.489 / SU ML: 0.133 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.175 / ESU R Free: 0.156 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.21775	4940	5 %	RANDOM
R_work	0.18008	-	-	-
obs	0.18195	94028	99.83 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 28.892 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.49 Å²	0 Å²	0.2 Å²
2-	-	-0.22 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.33 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 2.1→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10031	0	38	530	10599

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.019	10314
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	9641
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.307	1.956	13997
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.734	3	22207
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.444	5	1286
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.025	24.268	471
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.625	15	1698
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.949	15	62
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.075	0.2	1572
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.021	11721
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	2373
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.697	4.247	5150
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.697	4.246	5149
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.289	5.701	6422
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	2.289	5.702	6423
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	3.237	5.291	5164
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	3.231	5.291	5164
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	4.501	6.767	7572
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	6.202	11.784	11419
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	6.202	11.784	11419
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / 数: 2623 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
A	medium positional	0.27	0.5
B	medium positional	0.24	0.5
C	medium positional	0.23	0.5
D	medium positional	0.29	0.5
E	medium positional	0.26	0.5
A	medium thermal	1.86	2
B	medium thermal	1.83	2
C	medium thermal	1.66	2
D	medium thermal	1.6	2
E	medium thermal	1.65	2

LS精密化シェル

解像度: 2.1→2.154 Å

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.31	362	5 %
R_work	0.277	6891	-
obs	-	-	99.37 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.9959	-0.0825	0.8738	0.5757	-0.1161	3.0894	-0.0696	0.1002	0.0788	0.0947	0.0084	-0.0807	-0.0759	0.2826	0.0612	0.0618	-0.0006	-0.0444	0.2089	0.0209	0.1419	60.6072	11.4717	18.7366
2	0.4334	-0.2129	0.0915	0.9727	0.1306	0.7502	-0.0161	0.0844	-0.0008	-0.0281	0.0166	-0.0372	-0.0076	0.0722	-0.0005	0.0393	-0.0259	-0.0586	0.1913	0.0285	0.0991	58.0032	5.5917	18.4646
3	4.5558	0.1377	4.587	0.8228	0.0852	6.2861	-0.2105	0.0448	0.1031	0.0871	0.0329	-0.0614	-0.394	0.1137	0.1775	0.0428	-0.0229	-0.031	0.1143	0.0178	0.0842	59.0899	12.2123	23.9029
4	8.2612	-1.3547	4.2433	1.7307	-0.2097	5.1321	0.0909	-0.6172	0.1766	0.1458	-0.0212	-0.093	-0.3156	-0.3023	-0.0697	0.2421	0.0075	-0.0415	0.2011	-0.0004	0.1909	44.3045	30.5522	52.424
5	1.0324	-0.0288	-0.105	0.0969	-0.2381	1.141	-0.0249	0.0311	0.1205	0.0044	-0.0026	0.0151	-0.1522	-0.0618	0.0276	0.08	0.012	-0.0904	0.1508	0.017	0.1396	37.9763	25.3719	25.1666
6	2.5301	1.0921	2.5121	1.167	1.4764	4.4885	-0.049	-0.1221	0.0205	0.0275	-0.0127	-0.02	-0.1781	-0.0187	0.0617	0.0535	0.0266	-0.0569	0.1246	0.0214	0.1144	38.1696	25.9292	35.3769
7	4.4467	3.4121	3.5025	3.4771	2.3252	7.083	0.3019	-0.2015	-0.301	0.4969	-0.0328	-0.1377	0.3923	-0.2352	-0.2691	0.1986	0.0413	-0.0434	0.2652	0.0066	0.2009	21.8056	5.3777	63.3445
8	0.6116	0.0595	0.2366	1.4227	-0.0552	0.435	-0.0084	0.0347	0.054	-0.0135	-0.0004	0.0743	-0.055	-0.1204	0.0088	0.0367	0.0239	-0.0544	0.2396	0.006	0.1127	15.4507	11.4036	35.5027
9	1.15	0.1478	1.4998	0.944	0.6668	5.5843	0.0223	-0.0803	0.0383	0.0998	0.0126	-0.0276	-0.0209	-0.0643	-0.035	0.0295	-0.0005	-0.0428	0.1473	0.0108	0.1164	19.3277	7.0062	45.8706
10	1.5697	-0.6766	2.8529	3.0292	2.6197	10.8715	0.0118	0.058	-0.0077	0.2676	-0.1054	-0.0329	0.4878	0.174	0.0936	0.1656	-0.0488	-0.0057	0.2444	0.0746	0.1799	35.3251	-24.6692	56.3847
11	1.0396	-0.229	-0.0302	0.5296	0.2938	0.9773	-0.0025	0.0198	-0.0472	-0.0339	0.0228	0.0941	0.0786	-0.1014	-0.0203	0.0503	-0.029	-0.0763	0.1708	0.0134	0.1331	20.7676	-16.4989	33.1908
12	0.9611	-0.256	1.0101	0.7973	-1.015	6.4857	-0.0489	-0.0826	0.0123	0.0602	0.0293	0.0176	0.0158	-0.0381	0.0196	0.0263	0.0003	-0.0446	0.1225	0.003	0.1205	28.1975	-19.4293	40.5999
13	2.377	-0.0796	0.8069	0.3842	-0.9163	9.6214	-0.0759	-0.0072	0.0058	0.1601	-0.1202	-0.1687	-0.4061	0.3602	0.1961	0.1465	0.0248	-0.0619	0.1728	-0.0195	0.1881	65.6065	-20.1331	41.6931
14	0.7387	0.3076	0.1728	0.4646	-0.1227	1.02	0.0039	0.0828	-0.0496	-0.0772	0.0083	0.0046	0.0718	0.0154	-0.0122	0.0536	0.02	-0.0642	0.1662	-0.0293	0.1048	46.1376	-19.8211	20.8891
15	2.297	-0.8329	2.6424	1.3745	-1.3372	4.1639	0.0234	0.0218	-0.0144	0.0397	-0.0674	0.035	0.0201	0.1159	0.044	0.0182	-0.0013	-0.0319	0.1313	-0.0184	0.0826	53.7505	-17.7961	27.3652

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	24 - 68
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	69 - 263
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	264 - 289
4	X-RAY DIFFRACTION	4	B	24 - 42
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	43 - 237
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	238 - 288
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C	25 - 42
8	X-RAY DIFFRACTION	8	C	43 - 232
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	233 - 288
10	X-RAY DIFFRACTION	10	D	24 - 42
11	X-RAY DIFFRACTION	11	D	43 - 236
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	237 - 288
13	X-RAY DIFFRACTION	13	E	24 - 42
14	X-RAY DIFFRACTION	14	E	43 - 238
15	X-RAY DIFFRACTION	15	E	239 - 288

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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