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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4uzz | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the TtIFT52-46 complex | ||||||
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![]() | MOTOR PROTEIN / CILIUM / IFT / INTRACELLULAR TRANSPORT / FLAGELLUM | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Braeuer, P. / Taschner, M. / Lorentzen, E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structures of Ift70/52 and Ift52/46 Provide Insight Into Intraflagellar Transport B Core Complex Assembly. 著者: Taschner, M. / Kotsis, F. / Braeuer, P. / Kuehn, E.W. / Lorentzen, E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 46.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 33.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13460.124 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 221-332 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 7712.705 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 371-434 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | GAAS IS A LEFTOVER SEQUENCE FROM THE N-TERMINAL AFFINITY TAG |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 73 % / 解説: NONE |
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結晶化 | pH: 8.2 / 詳細: 50MM TRISD PH 8.2, 0.6M TRI-SODIUM- CITRATE |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年9月21日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.32→40 Å / Num. obs: 17160 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 6.2 % / Biso Wilson estimate: 71.12 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 17 |
反射 シェル | 解像度: 2.32→2.4 Å / 冗長度: 5.4 % / Rmerge(I) obs: 1.5 / Mean I/σ(I) obs: 0.6 / % possible all: 92.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: NONE 解像度: 2.318→42.197 Å / SU ML: 0.32 / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 38.81 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.318→42.197 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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