- PDB-4uiy: N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH N-(1,1-dioxo-1-thian-4-... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4uiy
タイトル
N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH N-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)- 5-methyl-4-oxo-7-3-(trifluoromethyl)phenyl-4H,5H-thieno-3,2-c- pyridine-2-carboximidamide
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97625 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.3→39.32 Å / Num. obs: 31523 / % possible obs: 96.6 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 5 % / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 16.5
反射 シェル
解像度: 1.3→1.37 Å / 冗長度: 4.1 % / Rmerge(I) obs: 0.24 / Mean I/σ(I) obs: 5.1 / % possible all: 86.5
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0117
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.3→39.32 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.974 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.964 / SU B: 1.393 / SU ML: 0.031 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.051 / ESU R Free: 0.054 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1847
1587
5 %
RANDOM
Rwork
0.15643
-
-
-
obs
0.15781
29935
96.06 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK