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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4uhj | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the receiver domain of CpxR from E. coli (orthorhombic form) | ||||||
![]() | TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN CPXR | ||||||
![]() | TRANSCRIPTION | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of cell-substrate adhesion / phosphorelay response regulator activity / protein-DNA complex / transcription cis-regulatory region binding / cell adhesion / DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of DNA-templated transcription / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mechaly, A.E. / Alzari, P.M.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Coupling between Autokinase and Phosphotransferase Reactions in a Bacterial Histidine Kinase. 著者: Mechaly, A.E. / Soto Diaz, S. / Sassoon, N. / Buschiazzo, A. / Betton, J.M. / Alzari, P.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 163.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 131.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 437.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 440.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15561.921 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.32 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.06 % / 解説: NONE |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.976 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→44.18 Å / Num. obs: 34820 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.8 % / Biso Wilson estimate: 36.31 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.03 / Net I/σ(I): 19.3 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→1.95 Å / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.63 / Mean I/σ(I) obs: 2 / % possible all: 99.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: NONE 解像度: 1.9→44.18 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.9486 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.9413 / SU R Cruickshank DPI: 0.144 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.149 / SU Rfree Blow DPI: 0.129 / SU Rfree Cruickshank DPI: 0.127
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原子変位パラメータ | Biso mean: 46.79 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→44.18 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.9→1.96 Å / Total num. of bins used: 17
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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