ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
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HKL-3000 | | データ削減 | REFMAC | 5.6.0117精密化 | PDB_EXTRACT | 3.14 | データ抽出 | |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: 436D 解像度: 1.48→17.12 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.938 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.906 / SU B: 2.033 / SU ML: 0.075 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.102 / ESU R Free: 0.11 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.3221 | 548 | 4.8 % | RANDOM |
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Rwork | 0.2663 | 10882 | - | - |
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obs | 0.2689 | 11430 | 98.28 % | - |
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK |
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原子変位パラメータ | Biso max: 67.71 Å2 / Biso mean: 27.935 Å2 / Biso min: 16.9 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
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1- | 0 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
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2- | - | -0.02 Å2 | 0 Å2 |
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3- | - | - | 0.02 Å2 |
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精密化ステップ | サイクル: final / 解像度: 1.48→17.12 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 486 | 43 | 30 | 559 |
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Biso mean | - | - | 46.52 | 30.11 | - |
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残基数 | - | - | - | - | 24 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | Dev ideal target | 数 |
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X-RAY DIFFRACTION | r_bond_refined_d0.015 | 0.012 | 591 | X-RAY DIFFRACTION | r_angle_refined_deg2.838 | 1.469 | 900 | X-RAY DIFFRACTION | r_chiral_restr0.102 | 0.2 | 72 | X-RAY DIFFRACTION | r_gen_planes_refined0.033 | 0.021 | 304 | | | | |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.48→1.518 Å / Total num. of bins used: 20
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.422 | 32 | - |
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Rwork | 0.348 | 672 | - |
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all | - | 704 | - |
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obs | - | - | 96.97 % |
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