- PDB-4u3v: Crystal structure of the trans-acyltransferase polyketide synthas... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 4u3v
タイトル
Crystal structure of the trans-acyltransferase polyketide synthase enoyl-isomerase
要素
Polyketide synthase PksR
キーワード
ISOMERASE / double-hotdog / polyketide / trans-AT
機能・相同性
機能・相同性情報
biosynthetic process / acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups / hydrolase activity, acting on ester bonds / phosphopantetheine binding / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基以外のアシル基を移すもの / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
モノクロメーター: Double crystal cryo-cooled / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.73→35.37 Å / Num. all: 25889 / Num. obs: 25889 / % possible obs: 97.6 % / 冗長度: 3.5 % / Net I/σ(I): 48.3
反射 シェル
冗長度: 2.4 % / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / % possible all: 74.4
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解析
ソフトウェア
名称: REFMAC / バージョン: 5.6.0117 / 分類: 精密化
精密化
解像度: 1.73→35.37 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.947 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.129 / ESU R Free: 0.119 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.23855
1380
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.21356
-
-
-
obs
0.21478
25889
97.57 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK