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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4rcb | ||||||
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タイトル | Crystal structure of E Coli Hfq | ||||||
![]() | RNA-binding protein Hfq | ||||||
![]() | RNA BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() sRNA-mediated post-transcriptional gene silencing / positive regulation of translation, ncRNA-mediated / RNA folding chaperone / regulation of translation, ncRNA-mediated / bent DNA binding / regulation of RNA stability / regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / RNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Su, J.Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Limited proteolysis improves E.coli Hfq crystal structure resolution 著者: Feng, S.Q. / Si, Y.L. / Song, C.Y. / Wang, P.Q. / Su, J.Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 25 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 422.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 424.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 6||||||||
単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7653.859 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP RESIDUES 5-71 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.3 % |
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: 0.5M Lithium chloride, 1.6M Ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP |
-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97159 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 1.63 Å / Num. obs: 7684 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: (phenix.refine: 1.9_1692) / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.63→26.531 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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