登録情報 | データベース: PDB / ID: 4plt |
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タイトル | Crystal structure of ancestral apicomplexan malate dehydrogenase with oxamate. |
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要素 | malate dehydrogenase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / Ancestral Sequence Reconstruction / Dehydrogenase / Apicomplexa / Specificity |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
lactate metabolic process / L-lactate dehydrogenase activity / pyruvate metabolic process / nucleotide binding類似検索 - 分子機能 Malate dehydrogenase, type 3 / L-2-Hydroxyisocaproate Dehydrogenase; Chain A, domain 2 / Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal / L-lactate/malate dehydrogenase / Lactate/malate dehydrogenase, N-terminal / Lactate/malate dehydrogenase, C-terminal / lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain / lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain / Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain ...Malate dehydrogenase, type 3 / L-2-Hydroxyisocaproate Dehydrogenase; Chain A, domain 2 / Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal / L-lactate/malate dehydrogenase / Lactate/malate dehydrogenase, N-terminal / Lactate/malate dehydrogenase, C-terminal / lactate/malate dehydrogenase, NAD binding domain / lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain / Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE / OXAMIC ACID / L-lactate dehydrogenase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Apicomplexa (真核生物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.6 Å |
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データ登録者 | Boucher, J.I. / Jacobowitz, J.R. / Beckett, B.C. / Classen, S. / Theobald, D.L. |
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資金援助 | 米国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | R01GM096053 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | R01GM094468 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | R01GM105404 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Elife / 年: 2014 タイトル: An atomic-resolution view of neofunctionalization in the evolution of apicomplexan lactate dehydrogenases. 著者: Boucher, J.I. / Jacobowitz, J.R. / Beckett, B.C. / Classen, S. / Theobald, D.L. |
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履歴 | 登録 | 2014年5月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年7月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年7月16日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2014年9月24日 | Group: Structure summary |
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改定 1.3 | 2014年10月1日 | Group: Database references |
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改定 1.4 | 2014年12月24日 | Group: Database references |
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改定 1.5 | 2015年2月25日 | Group: Derived calculations |
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改定 1.6 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / Derived calculations ...Author supporting evidence / Derived calculations / Other / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: entity_src_gen / pdbx_audit_support ...entity_src_gen / pdbx_audit_support / pdbx_database_status / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_oper_list / struct_keywords Item: _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization ..._entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_database_status.pdb_format_compatible / _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_assembly_prop.type / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_keywords.text |
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改定 1.7 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.8 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / refine_hist Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid / _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein |
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