登録情報 | データベース: PDB / ID: 4oop |
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タイトル | Arabidopsis thaliana dUTPase with with magnesium and alpha,beta-imido-dUTP |
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要素 | Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase |
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キーワード | HYDROLASE / dUTPase / hydrolysis / dUTP |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
dUTP catabolic process / dUMP biosynthetic process / dUTP diphosphatase / dUTP diphosphatase activity / DNA repair / magnesium ion binding / identical protein binding類似検索 - 分子機能 Deoxyuridine triphosphate nucleotidohydrolase / Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) / Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A / dUTPase-like / dUTPase / dUTPase, trimeric / dUTPase-like superfamily / Distorted Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2'-DEOXYURIDINE 5'-ALPHA,BETA-IMIDO-TRIPHOSPHATE / Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.5 Å |
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データ登録者 | Inoguchi, N. / Bajaj, M. / Moriyama, H. |
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引用 | ジャーナル: BMC Res Notes / 年: 2015 タイトル: Structural insights into the mechanism defining substrate affinity in Arabidopsis thaliana dUTPase: the role of tryptophan 93 in ligand orientation. 著者: Inoguchi, N. / Chaiseeda, K. / Yamanishi, M. / Kim, M.K. / Jang, Y. / Bajaj, M. / Chia, C.P. / Becker, D.F. / Moriyama, H. |
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履歴 | 登録 | 2014年2月3日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2015年4月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年7月6日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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