PDB-4onx: 2.8 Angstrom Crystal Structure of Sensor Domain of Histidine Kina...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4onx

タイトル

2.8 Angstrom Crystal Structure of Sensor Domain of Histidine Kinase from Clostridium perfringens.

要素

Sensor histidine kinase

キーワード

TRANSFERASE / Structural Genomics / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID / sensor histidine kinase

機能・相同性

機能・相同性情報

histidine kinase / phosphorelay sensor kinase activity / membrane => GO:0016020 / metal ion binding / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Clostridium perfringens (ウェルシュ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Minasov, G. / Halavaty, A. / Shuvalova, L. / Dubrovska, I. / Winsor, J. / Kwon, K. / Shatsman, S. / Anderson, W.F. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

引用

ジャーナル: TO BE PUBLISHED
タイトル: 2.8 Angstrom Crystal Structure of Sensor Domain of Histidine Kinase from Clostridium perfringens.
著者: Minasov, G. / Halavaty, A. / Shuvalova, L. / Dubrovska, I. / Winsor, J. / Kwon, K. / Shatsman, S. / Anderson, W.F. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

履歴

登録	2014年1月29日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年3月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月22日	Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name
改定 1.2	2024年11月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4onx.cif.gz	341.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4onx.ent.gz	283.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4onx.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4onx_validation.pdf.gz	485.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4onx_full_validation.pdf.gz	497.4 KB	表示
XML形式データ	4onx_validation.xml.gz	32.8 KB	表示
CIF形式データ	4onx_validation.cif.gz	41.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/4onx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/4onx	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	4z7h-d 3lj2-2 6eht-d 6xdd-d 3bep-d 3wfp-12 6w3c-1 4yzc-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CSGID-IDP04540

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#190 - 2015年10月 2つの要素で構成される検知・応答系 (Two-component Systems) 類似性 (9) #183 - 2015年3月フォトトロピン (Phototropin) 類似性 (3)

登録構造単位

A: Sensor histidine kinase

B: Sensor histidine kinase

C: Sensor histidine kinase

D: Sensor histidine kinase

E: Sensor histidine kinase

F: Sensor histidine kinase

ヘテロ分子

115 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	73.903, 82.739, 73.954
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 105.92, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	TYR	TYR	TYR	TYR	A	A	35 - 158	30 - 153
2	1	TYR	TYR	TYR	TYR	B	B	35 - 158	30 - 153
1	2	TYR	TYR	GLN	GLN	A	A	35 - 162	30 - 157
2	2	TYR	TYR	GLN	GLN	C	C	35 - 162	30 - 157
1	3	TYR	TYR	ASN	ASN	A	A	35 - 159	30 - 154
2	3	TYR	TYR	ASN	ASN	D	D	35 - 159	30 - 154
1	4	TYR	TYR	TYR	TYR	A	A	35 - 158	30 - 153
2	4	TYR	TYR	TYR	TYR	E	E	35 - 158	30 - 153
1	5	TYR	TYR	TYR	TYR	A	A	35 - 158	30 - 153
2	5	TYR	TYR	TYR	TYR	F	F	35 - 158	30 - 153
1	6	TYR	TYR	TYR	TYR	B	B	35 - 158	30 - 153
2	6	TYR	TYR	TYR	TYR	C	C	35 - 158	30 - 153
1	7	TYR	TYR	TYR	TYR	B	B	35 - 158	30 - 153
2	7	TYR	TYR	TYR	TYR	D	D	35 - 158	30 - 153
1	8	TYR	TYR	TYR	TYR	B	B	35 - 158	30 - 153
2	8	TYR	TYR	TYR	TYR	E	E	35 - 158	30 - 153
1	9	TYR	TYR	TYR	TYR	B	B	35 - 158	30 - 153
2	9	TYR	TYR	TYR	TYR	F	F	35 - 158	30 - 153
1	10	TYR	TYR	ASN	ASN	C	C	35 - 159	30 - 154
2	10	TYR	TYR	ASN	ASN	D	D	35 - 159	30 - 154
1	11	TYR	TYR	TYR	TYR	C	C	35 - 158	30 - 153
2	11	TYR	TYR	TYR	TYR	E	E	35 - 158	30 - 153
1	12	TYR	TYR	TYR	TYR	C	C	35 - 158	30 - 153
2	12	TYR	TYR	TYR	TYR	F	F	35 - 158	30 - 153
1	13	TYR	TYR	TYR	TYR	D	D	35 - 158	30 - 153
2	13	TYR	TYR	TYR	TYR	E	E	35 - 158	30 - 153
1	14	TYR	TYR	TYR	TYR	D	D	35 - 158	30 - 153
2	14	TYR	TYR	TYR	TYR	F	F	35 - 158	30 - 153
1	15	ASP	ASP	ASN	ASN	E	E	31 - 159	26 - 154
2	15	ASP	ASP	ASN	ASN	F	F	31 - 159	26 - 154

NCSアンサンブル:

ID
1
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詳細

Chains A, B, C, D, E, and F form a hexamer.

#1: タンパク質	Sensor histidine kinase 分子量: 19119.326 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Clostridium perfringens (ウェルシュ菌) 株: ATCC 13124 / 遺伝子: CPF_0511 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: Q0TTS5, UniProt: A0A0H2YV09*PLUS
#2: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 42 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 1.9 Å³/Da / 溶媒含有率: 35.1 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.3 詳細: Protein: 7.5 mG/mL, 0.25 M Sodium chloride, 0.01 M Tris-HCL buffer pH 8.3; Screen: Trap96 (B9), 0.2M Ammonium sulfate, 4% (w/v) Sugar; Cryo: 1:1, screen : 50% Sucrose., VAPOR DIFFUSION, ...詳細: Protein: 7.5 mG/mL, 0.25 M Sodium chloride, 0.01 M Tris-HCL buffer pH 8.3; Screen: Trap96 (B9), 0.2M Ammonium sulfate, 4% (w/v) Sugar; Cryo: 1:1, screen : 50% Sucrose., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K

結晶

マシュー密度: 1.9 Å³/Da / 溶媒含有率: 35.1 %

結晶化

温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.3
詳細: Protein: 7.5 mG/mL, 0.25 M Sodium chloride, 0.01 M Tris-HCL buffer pH 8.3; Screen: Trap96 (B9), 0.2M Ammonium sulfate, 4% (w/v) Sugar; Cryo: 1:1, screen : 50% Sucrose., VAPOR DIFFUSION, ...

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 21-ID-G / 波長: 0.97856 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2012年7月20日 / 詳細: Beryllium lenses
放射	モノクロメーター: Diamond / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97856 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→30 Å / Num. all: 21394 / Num. obs: 21394 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 5.1 % / B_iso Wilson estimate: 82.5 Å² / R_merge(I) obs: 0.077 / R_sym value: 0.077 / Net I/σ(I): 31.7
反射シェル	解像度: 2.8→2.85 Å / 冗長度: 5.1 % / R_merge(I) obs: 0.612 / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / Num. unique all: 1090 / R_sym value: 0.612 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Blu-Ice	Max	データ収集
PHENIX		モデル構築
REFMAC	5.7.0032	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 2.8→29.51 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.953 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.928 / SU B: 34.048 / SU ML: 0.325
Isotropic thermal model: Thermal Factors Individually Isotropically Refined
交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.399 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.24984	1088	5.1 %	RANDOM
R_work	0.19726	-	-	-
all	0.19993	20178	-	-
obs	0.19993	20178	99.88 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 95.512 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.83 Å²	-0 Å²	1.67 Å²
2-	-	-0.25 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.52 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.8→29.51 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6231	0	31	42	6304

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.009	0.019	6404
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.005	0.02	5989
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.506	1.969	8605
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.179	3	13809
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	2.346	5	765
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	22.553	25.468	331
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.194	15	1084
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	18.774	15	24
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.092	0.2	923
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.02	7247
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.004	0.02	1477
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	3.924	3.892	3069
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	3.925	3.892	3068
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	5.998	5.824	3831
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	5.998	5.824	3832
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	5.601	4.39	3335
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	5.459	4.369	3316
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	7.874	6.369	4745
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	11.238	31.966	7383
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	11.237	31.895	7372

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	6696	0.14
1	2	B	6696	0.14
2	1	A	7159	0.11
2	2	C	7159	0.11
3	1	A	6707	0.14
3	2	D	6707	0.14
4	1	A	6580	0.15
4	2	E	6580	0.15
5	1	A	6532	0.15
5	2	F	6532	0.15
6	1	B	6730	0.13
6	2	C	6730	0.13
7	1	B	7035	0.1
7	2	D	7035	0.1
8	1	B	6532	0.15
8	2	E	6532	0.15
9	1	B	6684	0.12
9	2	F	6684	0.12
10	1	C	6840	0.14
10	2	D	6840	0.14
11	1	C	6592	0.15
11	2	E	6592	0.15
12	1	C	6606	0.15
12	2	F	6606	0.15
13	1	D	6453	0.16
13	2	E	6453	0.16
14	1	D	6680	0.13
14	2	F	6680	0.13
15	1	E	6736	0.16
15	2	F	6736	0.16

LS精密化シェル

解像度: 2.8→2.872 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.292	75	-
R_work	0.252	1496	-
obs	-	1496	100 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	27.2669	-13.4806	-8.0772	8.3414	3.3715	5.352	0.0475	-0.3926	0.3011	-0.5678	0.2872	0.1639	-0.7599	0.0265	-0.3347	0.5405	-0.0363	-0.1524	0.1122	0.0963	0.331	-8.9573	1.9607	-38.6996
2	10.6018	-3.468	0.1188	9.4534	1.3305	0.2582	-0.1021	0.3381	0.2097	0.0385	0.073	-0.4069	0.0872	0.0684	0.0291	0.3368	0.0622	0.0979	0.1201	0.0793	0.3574	8.5315	-10.9137	-37.8609
3	24.5508	-2.0152	2.3665	0.5024	-1.6501	8.9153	-0.1286	-0.4591	-0.305	-0.106	0.0706	0.1489	-0.2851	-0.1178	0.058	0.4646	-0.0641	-0.0424	0.1001	-0.0137	0.443	1.5554	1.458	-31.4131
4	4.4019	-1.8583	-4.2925	8.9566	2.7509	4.355	-0.1555	-0.3107	0.2582	-0.0948	0.4199	0.2516	0.051	0.2258	-0.2644	0.2727	0.103	-0.0458	0.2648	0.0253	0.3072	0.7039	-9.4894	-29.3475
5	9.5795	0.9863	-12.533	0.2635	-1.1431	19.9328	0.1768	0.1031	0.1479	-0.0019	0.0347	0.3134	-1.6465	-1.1747	-0.2114	0.7175	0.279	0.0934	0.6186	0.0054	0.7123	-9.2593	1.5257	-9.065
6	7.6062	-3.6239	5.6992	1.7665	-3.0502	14.7824	-0.2567	-0.3033	-0.1653	0.1731	0.1028	0.1654	0.3954	-1.1567	0.1539	0.4485	-0.1805	0.176	0.7395	0.0122	0.4757	-11.5273	-6.8306	-7.0853
7	5.7832	-6.7312	-11.8853	7.9189	13.9945	24.7463	-0.3983	0.4024	-0.2453	0.459	-0.3356	0.4101	0.8138	-0.6634	0.734	0.4324	-0.0568	-0.0287	0.5033	0.1099	0.6981	-12.7898	-3.1312	-31.0501
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12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	85 - 106
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	107 - 115
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	116 - 123
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	124 - 137
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	138 - 159
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	35 - 52
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	53 - 66
19	X-RAY DIFFRACTION	19	C	67 - 96
20	X-RAY DIFFRACTION	20	C	97 - 109
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	110 - 119
22	X-RAY DIFFRACTION	22	C	120 - 132
23	X-RAY DIFFRACTION	23	C	133 - 140
24	X-RAY DIFFRACTION	24	C	141 - 162
25	X-RAY DIFFRACTION	25	D	35 - 57
26	X-RAY DIFFRACTION	26	D	58 - 73
27	X-RAY DIFFRACTION	27	D	74 - 97
28	X-RAY DIFFRACTION	28	D	98 - 108
29	X-RAY DIFFRACTION	29	D	109 - 117
30	X-RAY DIFFRACTION	30	D	118 - 132
31	X-RAY DIFFRACTION	31	D	133 - 141
32	X-RAY DIFFRACTION	32	D	142 - 160
33	X-RAY DIFFRACTION	33	E	31 - 52
34	X-RAY DIFFRACTION	34	E	53 - 86
35	X-RAY DIFFRACTION	35	E	87 - 101
36	X-RAY DIFFRACTION	36	E	102 - 123
37	X-RAY DIFFRACTION	37	E	124 - 137
38	X-RAY DIFFRACTION	38	E	138 - 148
39	X-RAY DIFFRACTION	39	E	149 - 156
40	X-RAY DIFFRACTION	40	E	157 - 159
41	X-RAY DIFFRACTION	41	F	31 - 40
42	X-RAY DIFFRACTION	42	F	41 - 52
43	X-RAY DIFFRACTION	43	F	53 - 86
44	X-RAY DIFFRACTION	44	F	87 - 102
45	X-RAY DIFFRACTION	45	F	103 - 123
46	X-RAY DIFFRACTION	46	F	124 - 137
47	X-RAY DIFFRACTION	47	F	138 - 149
48	X-RAY DIFFRACTION	48	F	150 - 159

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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