PDB-4obh: Crystal Structure of Inactive HIV-1 Protease in Complex with the ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4obh

タイトル

Crystal Structure of Inactive HIV-1 Protease in Complex with the p1-p6 substrate variant (L449F)

要素

HIV-1 Protease
p1-p6 peptide

キーワード

HYDROLASE / Co-evolution / Resistance

機能・相同性

機能・相同性情報

viral budding via host ESCRT complex / HIV-1 retropepsin / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...
類似検索 - 分子機能

Gag protein p6 / Gag protein p6 / gag protein p24 N-terminal domain / Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. / Integrase-like, N-terminal ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.85 Å

データ登録者

Kolli, M.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2014
タイトル: HIV-1 protease-substrate coevolution in nelfinavir resistance.
著者: Kolli, M. / Ozen, A. / Kurt-Yilmaz, N. / Schiffer, C.A.

履歴

登録	2014年1月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年11月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月22日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.2	2023年9月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4obh.cif.gz	132 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4obh.ent.gz	103.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4obh.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4obh_validation.pdf.gz	501.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4obh_full_validation.pdf.gz	507 KB	表示
XML形式データ	4obh_validation.xml.gz	20.8 KB	表示
CIF形式データ	4obh_validation.cif.gz	28.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ob/4obh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ob/4obh	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4obdC 4obfC 4obgC 4objC 4obkC 1t3rS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	4obf-1 2qnn-d 1hvs-d 3gga-1 3fsm-d 2cen-d 5ah6-d 1yt9-d 1ec0-d 6b3f-d 3sac-d 1msm-d 3qrm-d 3nu9-d 4fm6-d 4obg-1 1npa-d 1a30-d 6dj5-d 2wkz-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#6 - 2000年6月 HIV-1タンパク質分解酵素 (HIV-1 Protease) 類似性 (1) #226 - 2018年10月アミノグリコシド系抗生物質と耐性 (Aminoglycoside Antibiotics and Resistance) 類似性 (1) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (3) #87 - 2007年3月ジンクフィンガー (Zinc Fingers) 類似性 (2)

登録構造単位

A: HIV-1 Protease

B: HIV-1 Protease

C: HIV-1 Protease

D: HIV-1 Protease

E: p1-p6 peptide

F: p1-p6 peptide

ヘテロ分子

47.2 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: HIV-1 Protease

B: HIV-1 Protease

E: p1-p6 peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
23.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

C: HIV-1 Protease

D: HIV-1 Protease

F: p1-p6 peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
23.6 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	51.144, 62.787, 58.537
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 98.03, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

-
タンパク質 / タンパク質・ペプチド , 2種, 6分子 ABCDEF

#1: タンパク質	HIV-1 Protease / PR / Retropepsin 分子量: 10814.805 Da / 分子数: 4 / 変異: Q7K, D25N, V64I / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス) 株: group M subtype B (isolate ARV2/SF2) / 遺伝子: gag-pol / プラスミド: pXC35 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP106 / 参照: UniProt: P03369, HIV-1 retropepsin
#2: タンパク質・ペプチド	p1-p6 peptide 分子量: 1207.341 Da / 分子数: 2 / Fragment: UNP residues 446-455 / 変異: L6F / 由来タイプ: 合成由来: (合成) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) 参照: UniProt: P03349

#1: タンパク質

HIV-1 Protease / PR / Retropepsin

分子量: 10814.805 Da / 分子数: 4 / 変異: Q7K, D25N, V64I / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Human immunodeficiency virus type 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
株: group M subtype B (isolate ARV2/SF2) / 遺伝子: gag-pol / プラスミド: pXC35 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP106 / 参照: UniProt: P03369, HIV-1 retropepsin

#2: タンパク質・ペプチド

p1-p6 peptide

分子量: 1207.341 Da / 分子数: 2 / Fragment: UNP residues 446-455 / 変異: L6F / 由来タイプ: 合成
由来: (合成)

Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
参照: UniProt: P03349

-
非ポリマー , 5種, 236分子

#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 13 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#6: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 215 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.04 Å³/Da / 溶媒含有率: 39.63 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 28% PEG MME 5000, 0.2M Ammonium Sulfate, 0.5M MES monohydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 14-ID-B / 波長: 1.033 Å
検出器	タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2009年3月9日 / 詳細: Mirrors
放射	モノクロメーター: Si(111) double-crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.033 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.85→50 Å / Num. obs: 31329 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.9 % / R_sym value: 0.076 / Net I/σ(I): 16.5
反射シェル	解像度: 1.85→1.92 Å / 冗長度: 3.4 % / Mean I/σ(I) obs: 3.12 / R_sym value: 0.362 / % possible all: 99.5

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

R_factor: 43.5 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.5 Å	31.39 Å
Translation	2.5 Å	31.39 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.1.4	位相決定
REFMAC	5.5.0102	精密化
PDB_EXTRACT	3.14	データ抽出
BioCARS-developed	GUI	データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 1T3R

1t3r

解像度: 1.85→31.4 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.965 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.939 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 4.076 / SU ML: 0.097 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.141 / ESU R Free: 0.134 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.20882	1584	5.1 %	RANDOM
R_work	0.16081	-	-	-
obs	0.16327	29702	99.3 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 22.577 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-1.45 Å²	-0 Å²	-0.67 Å²
2-	-	0.64 Å²	-0 Å²
3-	-	-	0.95 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.85→31.4 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3114	0	97	215	3426

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.019	3263
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	3281
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.554	1.996	4410
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.694	3	7517
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.789	5	414
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	40.943	24.737	114
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	12.887	15	521
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.164	15	16
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.095	0.2	522
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.012	0.021	3596
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	672
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	2.073	1.712	1663
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	2.051	1.71	1661
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.844	2.548	2068
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.888	2.106	1600
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.85→1.897 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.259	133	-
R_work	0.208	2106	-
obs	-	-	95.68 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.3015	0.6523	-2.2557	2.8509	0.1594	2.4657	-0.195	0.0068	-0.126	-0.0909	0.1009	-0.0678	0.145	0.0433	0.094	0.1201	-0.0286	0.0181	0.0442	-0.0235	0.0717	-19.6858	-24.1024	-8.3868
2	5.307	-4.5897	0.3542	4.6408	0.3009	0.698	-0.0265	0.07	0.1948	-0.2348	-0.001	-0.1297	-0.1317	-0.0547	0.0275	0.2266	-0.0898	-0.0063	0.133	0.0274	0.05	-20.9675	-11.5661	-13.3856
3	8.2308	3.7043	1.9793	4.7085	0.4828	3.3851	-0.1667	-0.5062	-0.1452	0.1316	-0.1273	-0.0788	0.0073	0.0176	0.294	0.1107	0.0209	-0.0075	0.0961	0.0179	0.1072	-18.8008	-22.1666	4.6002
4	2.0564	-1.9433	0.7516	2.3253	-1.2507	0.8726	0.0203	0.0532	-0.1122	-0.0424	-0.0656	0.0204	0.0337	0.0328	0.0453	0.0658	-0.012	0.0026	0.0315	-0.0056	0.0864	-25.854	-14.1713	-1.1677
5	9.0114	0.3225	-1.6588	4.4789	-0.7049	9.3488	0.0196	0.3973	0.1295	-0.2175	0.0064	0.2768	-0.0176	-0.6869	-0.026	0.0244	0.0073	-0.0223	0.0615	-0.0041	0.0459	-39.8513	-7.5794	4.1393
6	4.5556	0.7891	1.5789	0.2066	-0.2051	3.95	0.0114	0.0338	-0.1863	-0.0036	0.0143	-0.0464	-0.0579	-0.0168	-0.0257	0.0871	-0.0063	0.031	0.0121	-0.025	0.0587	-14.2594	-12.8763	-2.7001
7	5.8046	0.468	-0.2718	4.5117	-4.294	5.6421	0.063	-0.1887	-0.0388	0.0385	-0.1733	-0.4505	0.0776	0.3677	0.1103	0.0468	0.0019	0.001	0.0585	-0.041	0.135	-0.5664	-5.0051	0.856
8	11.0404	3.398	-4.1206	1.3638	-0.0962	5.8872	-0.0021	-0.0806	0.121	-0.0211	-0.0498	0.0573	-0.1031	-0.0903	0.0519	0.0832	0.0186	-0.0086	0.0277	-0.0192	0.04	-27.9654	-5.9325	10.5436
9	11.729	3.6058	-2.6765	3.864	-1.0349	4.4773	0.0017	0.1002	0.1676	-0.0791	-0.0791	0.1147	-0.0129	0.1086	0.0774	0.0571	0.0055	0.0025	0.0118	-0.0078	0.0556	-12.6957	1.2596	-0.6702
10	2.8529	2.4063	0.652	5.7285	2.6636	2.1973	-0.0308	-0.2707	0.0705	0.3442	-0.242	0.5228	0.1317	-0.1292	0.2728	0.0749	0.01	0.036	0.0564	-0.0145	0.0955	-38.4928	-12.565	7.5526
11	7.5969	-1.2406	-6.1439	1.5593	1.8801	9.923	0.0001	0.0784	0.1498	-0.0357	0.0744	0.0151	0.1652	-0.045	-0.0745	0.051	0.0044	-0.0117	0.0119	0.0131	0.0453	-37.1092	-19.1599	-5.1884
12	0.8089	0.3069	-0.4699	5.8484	5.4716	8.081	-0.1272	0.0487	-0.0422	-0.1805	0.0363	0.1725	0.0684	0.0175	0.091	0.0799	0.0233	0.0124	0.0213	0.0098	0.0789	-36.4926	-19.7147	0.308
13	2.3971	-3.7997	0.7227	10.0044	4.5599	8.4089	0.0904	0.1224	0.1685	-0.3987	-0.0748	-0.3096	-0.3255	0.1764	-0.0157	0.0451	-0.0389	0.0346	0.0773	0.0016	0.101	-1.7647	-4.3182	-5.8646
14	4.0178	3.769	-1.8168	10.4276	-3.7928	2.7966	0.1627	-0.1446	-0.0531	0.0447	-0.1529	-0.0221	0.0842	0.1381	-0.0097	0.0553	0.009	-0.0024	0.058	-0.0107	0.0344	-3.0309	-18.5572	-5.1098
15	2.6997	0.2516	-1.5038	0.1926	-0.8022	3.6193	-0.0776	0.1513	-0.2268	-0.0486	0.0073	0.0232	0.1394	0.0242	0.0703	0.0763	-0.0388	-0.007	0.0796	-0.0255	0.1555	-4.4018	-12.8304	-7.9438
16	0.9741	-1.7919	-1.2756	3.3	2.4514	5.3219	0.0422	0.0648	0.0778	-0.0906	-0.12	-0.1456	-0.4075	-0.0935	0.0778	0.0936	0.0014	-0.0051	0.0249	0.005	0.0842	-29.8296	-7.3675	-0.6809
17	1.3311	1.995	1.2538	4.0551	0.2725	3.6063	0.0817	-0.0415	-0.1195	0.1256	-0.0088	-0.2103	0.0747	-0.123	-0.0729	0.062	0.0032	-0.0017	0.0413	-0.0019	0.051	-10.4464	-9.0988	3.2356
18	2.3308	-0.8147	0.8342	5.0432	1.8852	1.3015	-0.1658	-0.0817	-0.026	-0.0231	0.1503	0.1212	-0.0785	0.0195	0.0156	0.103	-0.0188	-0.0078	0.0383	0.0219	0.1182	-28.5802	-21.5067	0.174
19	7.7313	0.4722	-1.4832	4.3772	-1.3216	0.663	-0.0408	-0.0219	-0.2455	-0.1074	-0.063	-0.2564	-0.0079	0.0689	0.1039	0.1171	-0.05	0.0344	0.0937	-0.0273	0.056	-11.315	-15.0673	-9.8489

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 5
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	94 - 99
3	X-RAY DIFFRACTION	1	B	1 - 5
4	X-RAY DIFFRACTION	1	B	94 - 99
5	X-RAY DIFFRACTION	2	A	6 - 10
6	X-RAY DIFFRACTION	3	B	6 - 10
7	X-RAY DIFFRACTION	4	A	22 - 32
8	X-RAY DIFFRACTION	5	A	33 - 43
9	X-RAY DIFFRACTION	6	B	22 - 32
10	X-RAY DIFFRACTION	7	B	33 - 43
11	X-RAY DIFFRACTION	8	A	44 - 49
12	X-RAY DIFFRACTION	8	A	52 - 56
13	X-RAY DIFFRACTION	9	B	44 - 49
14	X-RAY DIFFRACTION	9	B	52 - 56
15	X-RAY DIFFRACTION	10	A	57 - 62
16	X-RAY DIFFRACTION	11	A	63 - 68
17	X-RAY DIFFRACTION	12	A	69 - 76
18	X-RAY DIFFRACTION	13	B	57 - 62
19	X-RAY DIFFRACTION	14	B	63 - 68
20	X-RAY DIFFRACTION	15	B	69 - 76
21	X-RAY DIFFRACTION	16	A	77 - 85
22	X-RAY DIFFRACTION	17	B	77 - 85
23	X-RAY DIFFRACTION	18	A	86 - 93
24	X-RAY DIFFRACTION	19	B	86 - 93

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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