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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4n5x | ||||||
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タイトル | Crystal structure of N-terminal calmodulin-like Calcium sensor of human mitochondrial ATP-Mg/Pi carrier SCaMC1 | ||||||
![]() | Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 | ||||||
![]() | CALCIUM-BINDING PROTEIN / Calmodulin / Calcium sensor / mitochondrial inner membrane | ||||||
機能・相同性 | ![]() adenine nucleotide transmembrane transporter activity / adenine nucleotide transport / ATP:phosphate antiporter activity / ADP:phosphate antiporter activity / ADP transport / mitochondrial ATP transmembrane transport / ATP transmembrane transporter activity / ATP transport / mitochondrial transport / cellular response to calcium ion ...adenine nucleotide transmembrane transporter activity / adenine nucleotide transport / ATP:phosphate antiporter activity / ADP:phosphate antiporter activity / ADP transport / mitochondrial ATP transmembrane transport / ATP transmembrane transporter activity / ATP transport / mitochondrial transport / cellular response to calcium ion / cellular response to oxidative stress / mitochondrial inner membrane / calcium ion binding / mitochondrion / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yang, Q. / Bruschweiler, S. / Chou, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A Self-Sequestered Calmodulin-like Ca(2+) Sensor of Mitochondrial SCaMC Carrier and Its Implication to Ca(2+)-Dependent ATP-Mg/Pi Transport. 著者: Yang, Q. / Bruschweiler, S. / Chou, J.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 50.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 33.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1cllS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 22932.492 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 1-193 / 変異: C15S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / #3: 化合物 | ChemComp-PEG / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 33.56 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 9.1 詳細: 100 mM CHES (pH 9.1) and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | ||||||||||||||||||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2012年5月4日 | ||||||||||||||||||||||||||||||
放射 | モノクロメーター: Xenocs mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: neutron | ||||||||||||||||||||||||||||||
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
反射 | 解像度: 2.1→20 Å / Num. all: 10500 / Num. obs: 10443 / % possible obs: 99.73 % / Observed criterion σ(I): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
反射 シェル |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1CLL 解像度: 2.1→19.072 Å / SU ML: 0.22 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 20.84 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→19.072 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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