登録情報 | データベース: PDB / ID: 4ml2 |
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タイトル | Crystal structure of wild-type YafQ |
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要素 | mRNA interferase YafQ |
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キーワード | TOXIN / antitoxin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
toxin-antitoxin complex / single-species biofilm formation / regulation of growth / mRNA catabolic process / translational termination / RNA endonuclease activity / RNA endonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters / ribosome binding / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / response to antibiotic ...toxin-antitoxin complex / single-species biofilm formation / regulation of growth / mRNA catabolic process / translational termination / RNA endonuclease activity / RNA endonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters / ribosome binding / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / response to antibiotic / negative regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / RNA binding類似検索 - 分子機能 Toxin-antitoxin system, YafQ-like toxin / Bacterial toxin of type II toxin-antitoxin system, YafQ / RelE-like / Toxin-antitoxin system, RelE/ParE toxin family / YaeB-like fold / Toxin-antitoxin system, RelE/ParE toxin domain superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.5 Å |
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データ登録者 | Liang, Y.J. / Gao, Z.Q. / Liu, Q.S. / Dong, Y.H. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2014 タイトル: Structural and Functional Characterization of Escherichia coli Toxin-Antitoxin Complex DinJ-YafQ 著者: Liang, Y. / Gao, Z. / Wang, F. / Zhang, Y. / Dong, Y. / Liu, Q. |
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履歴 | 登録 | 2013年9月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年6月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年8月20日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name |
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改定 1.3 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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