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- PDB-4mby: Structure of B-Lymphotropic Polyomavirus VP1 in complex with 3'-s... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 4mby
タイトルStructure of B-Lymphotropic Polyomavirus VP1 in complex with 3'-sialyllactose
要素Major Capsid Protein VP1
キーワードVIRAL PROTEIN / jelly roll / Polyomavirus / viral capsid (structural) protein / DNA encapsidation / receptor binding / Sialylated oligosaccharides
機能・相同性
機能・相同性情報


T=7 icosahedral viral capsid / endocytosis involved in viral entry into host cell / virion attachment to host cell / host cell nucleus / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能
Capsid protein VP1,Polyomavirus / Polyomavirus Vp1; Chain A / Capsid protein VP1,Polyomavirus / Polyomavirus capsid protein VP1 superfamily / Polyomavirus coat protein / Double-stranded DNA virus, group I, capsid / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
ISOPROPYL ALCOHOL / Major capsid protein VP1
類似検索 - 構成要素
生物種B-lymphotropic polyomavirus (ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.48 Å
データ登録者Khan, Z.M. / Neu, U. / Stehle, T.
引用ジャーナル: Plos Pathog. / 年: 2013
タイトル: Structures of B-Lymphotropic Polyomavirus VP1 in Complex with Oligosaccharide Ligands.
著者: Neu, U. / Khan, Z.M. / Schuch, B. / Palma, A.S. / Liu, Y. / Pawlita, M. / Feizi, T. / Stehle, T.
履歴
登録2013年8月21日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02013年12月4日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12014年1月22日Group: Source and taxonomy
改定 2.02020年7月29日Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen
Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id
解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.12024年2月28日Group: Data collection / Database references / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2
Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 2.22024年4月3日Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Major Capsid Protein VP1
B: Major Capsid Protein VP1
C: Major Capsid Protein VP1
D: Major Capsid Protein VP1
E: Major Capsid Protein VP1
F: Major Capsid Protein VP1
G: Major Capsid Protein VP1
H: Major Capsid Protein VP1
I: Major Capsid Protein VP1
J: Major Capsid Protein VP1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)309,16081
ポリマ－301,25110
非ポリマー7,90971
水50,8742824
1
A: Major Capsid Protein VP1
B: Major Capsid Protein VP1
C: Major Capsid Protein VP1
D: Major Capsid Protein VP1
E: Major Capsid Protein VP1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)154,90245
ポリマ－150,6255
非ポリマー4,27740
水905
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area34070 Å2
ΔGint-204 kcal/mol
Surface area54260 Å2
手法PISA
2
F: Major Capsid Protein VP1
G: Major Capsid Protein VP1
H: Major Capsid Protein VP1
I: Major Capsid Protein VP1
J: Major Capsid Protein VP1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)154,25836
ポリマ－150,6255
非ポリマー3,63331
水905
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area32550 Å2
ΔGint-215 kcal/mol
Surface area53920 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)150.530, 97.210, 234.660
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 96.25, 90.00
Int Tables number5
Space group name H-MC121
非結晶学的対称性 (NCS)NCS oper:
IDCodeMatrixベクター
1given(1), (1), (1)
2given(0.456799, -0.843115, 0.283711), (0.841876, 0.306704, -0.444047), (0.287367, 0.44169, 0.8499)0.64405, -0.78251, -0.43348
3given(-0.421037, -0.521879, 0.741869), (0.516115, -0.810426, -0.277192), (0.745891, 0.266181, 0.610569)1.85802, -0.13757, -1.14784
4given(-0.422117, 0.519805, 0.742711), (-0.521693, -0.80931, 0.269914), (0.741386, -0.273532, 0.612803)1.96263, 0.74516, -1.10052
5given(0.456195, 0.843316, 0.284084), (-0.843489, 0.308056, 0.440032), (0.283572, -0.440362, 0.851861)0.80588, 1.12875, -0.43533
6given(-0.977054, -0.2112, -0.027578), (-0.212921, 0.971853, 0.100824), (0.005508, 0.104382, -0.994522)64.76823, 0.67229, 115.4953
7given(-0.265232, -0.885337, -0.381877), (-0.891958, 0.074895, 0.445872), (-0.366146, 0.458878, -0.809548)62.491, 2.80355, 116.70587
8given(0.529351, -0.339536, -0.777498), (-0.339201, -0.924693, 0.172875), (-0.777644, 0.172217, -0.604658)59.93449, 0.92705, 118.13284
9given(0.304907, 0.672892, -0.673979), (0.684628, -0.646809, -0.336042), (-0.662055, -0.358963, -0.657897)60.83443, -2.39126, 117.57679
10given(-0.624128, 0.752755, -0.209343), (0.760537, 0.523922, -0.383522), (-0.179018, -0.39858, -0.899493)63.70058, -2.44629, 116.0251

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 10分子 ABCDEFGHIJ

#1: タンパク質
Major Capsid Protein VP1


分子量: 30125.059 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) B-lymphotropic polyomavirus (ウイルス)
遺伝子: VP1 / プラスミド: pET15b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P04010*PLUS

-
糖 , 2種, 9分子

#2: 多糖
N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 471.411 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-ROHGlycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/2,2,1/[a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2/a3-b2WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}LINUCSPDB-CARE
#3: 多糖 N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 633.552 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-4DGlcpb1-ROHGlycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/3,3,2/[a2122h-1b_1-5][a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2-3/a4-b1_b3-c2WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[][b-D-Glcp]{[(4+1)][b-D-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}}LINUCSPDB-CARE

-
非ポリマー , 5種, 2886分子

#4: 化合物
ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン


分子量: 40.078 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#5: 化合物
ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド


分子量: 35.453 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#6: 化合物...
ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル


分子量: 62.068 Da / 分子数: 32 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6O2
#7: 化合物
ChemComp-IPA / ISOPROPYL ALCOHOL / 2-PROPANOL / 2-プロパノ-ル


分子量: 60.095 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: C3H8O / コメント: alkaloid*YM
#8: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 2824 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.83 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.58 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.8
詳細: 12% (v/v) Isopropanol, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折平均測定温度: 93 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06SA / 波長: 1 Å
検出器タイプ: PSI PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2011年7月19日
放射モノクロメーター: DCCM / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.48→50 Å / Num. all: 557647 / Num. obs: 549960 / % possible obs: 98.62 % / Observed criterion σ(F): -3 / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3 % / Biso Wilson estimate: 25 Å2 / Net I/σ(I): 17.5
反射 シェル解像度: 1.48→1.52 Å / 冗長度: 3 % / Mean I/σ(I) obs: 2.4 / Num. unique all: 41273 / % possible all: 98.5

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
RemDAqデータ収集
MOLREP位相決定
REFMAC5.8.0025精密化
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: LPyV native structure

解像度: 1.48→48.82 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.971 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.964 / SU B: 2.304 / SU ML: 0.044 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.06 / ESU R Free: 0.061 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.18578 27599 5 %RANDOM
Rwork0.16531 ---
all0.16634 557628 --
obs0.16634 522360 98.62 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso mean: 22.628 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--0.04 Å2-0 Å2-0.62 Å2
2--0.47 Å2-0 Å2
3----0.35 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.48→48.82 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数20846 0 498 2824 24168
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0080.0222386
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.2621.99230574
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg5.78752889
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg34.98625.413883
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg11.133153599
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg17.1081570
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0820.23523
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0060.02116842
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTIONr_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_it1.1192.27311248
X-RAY DIFFRACTIONr_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_it1.7443.8314127
X-RAY DIFFRACTIONr_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_it2.2473.06311137
X-RAY DIFFRACTIONr_scbond_other
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_it
X-RAY DIFFRACTIONr_scangle_other
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_refined6.8929.42336974
X-RAY DIFFRACTIONr_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded
LS精密化 シェル解像度: 1.48→1.518 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.25 2052 -
Rwork0.24 38563 -
obs--98.49 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
11.85562.68883.55534.21875.112119.17580.1302-0.04770.0664-0.0417-0.15250.2105-0.0361-0.92540.02220.17850.0498-0.0530.25110.0240.158843.410125.750953.4162
22.30040.00052.13671.0114-0.52243.7627-0.12540.10390.26150.0179-0.01060.0621-0.32280.04150.1360.04020.00290.01570.07340.00060.090542.556129.436893.3854
31.0831-0.27080.89510.3923-0.36651.5169-0.0759-0.07650.11670.06580.01460.0398-0.184-0.13820.06120.03120.010.01880.0592-0.02150.081531.404225.765392.9098
40.6626-0.0640.10830.2918-0.13470.5295-0.003-0.03010.03880.0293-0.00310.0436-0.0147-0.04250.00610.01420.00380.02070.0519-0.01220.0537.926618.289196.6182
514.6131-10.4626-14.02138.439512.718621.2151-0.249-0.3514-0.08010.41320.23330.06110.72160.13070.01570.21270.10670.06860.14250.02970.144512.901928.037778.9173
69.2847-0.15874.8170.0340.21127.5408-0.3455-0.11480.5839-0.07350.0448-0.0063-0.7276-0.15540.30080.2841-0.0018-0.02160.21730.03150.145657.7414-2.499446.6329
70.9929-0.16850.11820.77990.36932.94660.02880.07540.0781-0.0749-0.008-0.0841-0.15340.1192-0.02080.02190.00120.02150.06920.00940.068770.711117.435584.5671
81.26620.0621.69970.24250.25315.3722-0.10410.26480.1784-0.0697-0.0173-0.0583-0.48280.31630.12130.0641-0.01770.02890.10390.0340.086162.982725.882370.7103
90.4513-0.1790.0640.6369-0.09290.64910.01650.02010.0411-0.0106-0.0047-0.0063-0.00330.04-0.01180.0078-0.00480.0170.0645-0.00250.038861.161716.847384.9294
108.9401-5.622.01756.5101-3.70895.46510.14230.27520.4691-0.1474-0.0771-0.0351-0.284-0.0957-0.06520.0796-0.00120.01430.15030.02410.057452.782425.477556.9313
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480.71320.02620.8740.9223-0.13551.9836-0.030.25580.0075-0.1408-0.0203-0.1846-0.04960.37860.05030.15220.00770.05590.19190.00820.086443.12051.66439.6024
490.4516-0.04170.13030.5036-0.05130.3527-0.01530.0665-0.0044-0.0698-0.0156-0.0627-0.00750.04870.03090.13020.00430.0210.13730.00290.038735.4647-0.52215.2216
507.5984-5.05054.98056.8487-5.68484.92630.04990.2696-0.198-0.0539-0.1918-0.21610.07960.2330.14190.1156-0.0116-0.01310.16820.00120.105555.0181-0.369734.9727
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A26 - 38
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24X-RAY DIFFRACTION24E148 - 229
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26X-RAY DIFFRACTION26F26 - 38
27X-RAY DIFFRACTION27F39 - 75
28X-RAY DIFFRACTION28F76 - 108
29X-RAY DIFFRACTION29F109 - 154
30X-RAY DIFFRACTION30F155 - 299
31X-RAY DIFFRACTION31G26 - 39
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33X-RAY DIFFRACTION33G76 - 110
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46X-RAY DIFFRACTION46J26 - 38
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48X-RAY DIFFRACTION48J48 - 107
49X-RAY DIFFRACTION49J108 - 288
50X-RAY DIFFRACTION50J289 - 300

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万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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