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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4le4 | |||||||||
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タイトル | Crystal structure of PaGluc131A with cellotriose | |||||||||
![]() | Beta-glucanase | |||||||||
![]() | HYDROLASE / glucanse / GH131 | |||||||||
機能・相同性 | ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Jiang, T. / Chan, H.C. / Huang, C.H. / Ko, T.P. / Huang, T.Y. / Liu, J.R. / Guo, R.T. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structures of a GH131 beta-Glucanase Catalytic Domain from Podospora anserina in Complex with Cellotriose 著者: Jiang, T. / Chan, H.C. / Huang, C.H. / Ko, T.P. / Huang, T.Y. / Liu, J.R. / Guo, R.T. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 225.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 179.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 733.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 748.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 49.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 74.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 4le3S S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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3 | ![]()
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4 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 27718.361 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 19-270 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 多糖 | beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose / beta-cellotriose | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.26 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.59 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 0.1M HEPES, 0.7M LiCl, 33% PEG6K, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2013年5月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9762 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→25 Å / Num. obs: 87110 / % possible obs: 97 % / 冗長度: 3.4 % |
反射 シェル | 解像度: 1.8→1.86 Å / 冗長度: 3.3 % / Rmerge(I) obs: 0.297 / Mean I/σ(I) obs: 3 / Num. unique all: 8638 / % possible all: 95.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 4LE3 解像度: 1.8→25 Å / σ(F): 3 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→25 Å
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.8→1.86 Å /
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