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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4kef | ||||||
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タイトル | Structure of Cofilin Mutant (cof1-159p) | ||||||
![]() | Cofilin | ||||||
![]() | Actin Binding Protein / Actin Depolymerization Factor | ||||||
機能・相同性 | ![]() actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton ...actin filament fragmentation / actin cortical patch / actin filament severing / Golgi to plasma membrane protein transport / actin filament depolymerization / actin filament organization / nuclear matrix / endocytosis / actin filament binding / actin cytoskeleton / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kish-Trier, E. / Haarer, B. / Cingolani, G. / Amberg, D.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of Cofilin Mutant (cof1-159p) 著者: Kish-Trier, E. / Haarer, B. / Cingolani, G. / Amberg, D.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 96 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 414.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 414.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15831.506 Da / 分子数: 1 / 変異: K82D / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: COF1, YLL050C, L0596 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.94 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.73 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.4 詳細: 20% PEG4000, 150mM NaCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.098→30 Å / Num. obs: 49213 / % possible obs: 99.77 % / Observed criterion σ(F): 2.8 / Observed criterion σ(I): 2.8 / 冗長度: 4.2 % / Biso Wilson estimate: 10.45 Å2 / Rsym value: 0.076 / Net I/σ(I): 2.8 |
反射 シェル | 解像度: 1.098→1.14 Å / 冗長度: 2.3 % / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / Num. unique all: 205008 / Rsym value: 0.345 / % possible all: 98.99 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.098→28.697 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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