PDB-4kdm: Crystal structure of the hemagglutinin of ferret-transmissible H5...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4kdm

タイトル

Crystal structure of the hemagglutinin of ferret-transmissible H5N1 virus

要素

(Hemagglutinin) x 2

キーワード

VIRAL PROTEIN / homotrimer / virus attachment and membrane fusion

機能・相同性

機能・相同性情報

clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / identical protein binding / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

influenza virus (インフルエンザウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.496 Å

データ登録者

Lu, X. / Shi, Y. / Zhang, W. / Zhang, Y. / Qi, J. / Gao, G.F.

引用

ジャーナル: Protein Cell / 年: 2013
タイトル: Structure and receptor-binding properties of an airborne transmissible avian influenza A virus hemagglutinin H5 (VN1203mut).
著者: Lu, X. / Shi, Y. / Zhang, W. / Zhang, Y. / Qi, J. / Gao, G.F.

履歴

登録	2013年4月25日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年7月24日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年9月4日	Group: Database references
改定 1.2	2014年10月29日	Group: Structure summary
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / entity_src_gen / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_entity_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_entity_nonpoly.entity_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年11月6日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4kdm.cif.gz	600.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4kdm.ent.gz	499.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4kdm.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4kdm_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4kdm_full_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示
XML形式データ	4kdm_validation.xml.gz	64 KB	表示
CIF形式データ	4kdm_validation.cif.gz	81.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kd/4kdm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kd/4kdm	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4kdnC 4kdoC 4kdqC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2fk0-1 5huf-d 4n5z-2 2fk0-4 5e2y-d 2fk0-3 5e2z-d 2fk0-2 4kwm-1 5hu8-d 4yya-1 3m6s-2 4lxv-2 3ubj-2 4mhi-2 4kwm-3 4jul-1 3ube-1 4hmg-d 6e7g-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (6) #76 - 2006年4月赤血球凝集素 (Hemagglutinin) 類似性 (5) #259 - 2021年7月人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science) 類似性 (5) #62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (5) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (5) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (1)

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「今月の分子」の関連する項目

#170 - 2014年2月
広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies)
類似性 (6)
#76 - 2006年4月
赤血球凝集素 (Hemagglutinin)
類似性 (5)
#259 - 2021年7月
人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science)
類似性 (5)
#62 - 2005年2月
主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex)
類似性 (5)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (5)
#200 - 2016年8月
正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Hemagglutinin

B: Hemagglutinin

C: Hemagglutinin

D: Hemagglutinin

E: Hemagglutinin

F: Hemagglutinin

ヘテロ分子

172 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	66.758, 243.848, 71.614
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 110.01, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質

Hemagglutinin

分子量: 36447.383 Da / 分子数: 3 / 断片: Residues 17-337 / 変異: N170D, N236K, Q238L, T331I / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)
株: (A/Viet Nam/1203/2004(H5N1)) / 遺伝子: HA
発現宿主:

Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
参照: UniProt: Q6DQ33

#2: タンパク質

Hemagglutinin

分子量: 20170.232 Da / 分子数: 3 / 断片: Residues 347-521 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)
株: (A/Viet Nam/1203/2004(H5N1)) / 遺伝子: HA
発現宿主:

Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
参照: UniProt: Q6DQ33

#3: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

influenza virus (インフルエンザウイルス)
発現宿主:

Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#4: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆
由来: (組換発現)

influenza virus (インフルエンザウイルス)
発現宿主:

Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 170 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.22 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.86 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6 詳細: 0.1 M sodium cacodylate pH6.0 15% w/v PEG 4,000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2012年1月1日
放射	モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.496→50 Å / Num. all: 73995 / Num. obs: 73995 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -3
反射シェル	解像度: 2.5→2.59 Å / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
ADSC	Quantum	データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.8_1069)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.496→35.066 Å / SU ML: 0.32 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 29.79 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2508	3722	5.03 %	RANDOM
R_work	0.2151	-	-	-
all	0.217	73934	-	-
obs	0.217	73934	99.43 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.496→35.066 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11925	0	126	170	12221

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.005	12345
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.083	16683
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	19.075	4608
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.081	1791
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	2169

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.4957-2.5273	0.3911	124	0.3188	2523	X-RAY DIFFRACTION	96
2.5273-2.5606	0.38	147	0.3097	2678	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5606-2.5956	0.3312	151	0.302	2508	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5956-2.6327	0.3043	132	0.2893	2620	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6327-2.672	0.3406	129	0.291	2657	X-RAY DIFFRACTION	100
2.672-2.7137	0.3629	102	0.2916	2586	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7137-2.7582	0.3653	138	0.2814	2651	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7582-2.8057	0.293	125	0.2765	2611	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8057-2.8567	0.3168	136	0.2717	2620	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8567-2.9116	0.2971	140	0.2603	2611	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9116-2.971	0.3381	145	0.2635	2604	X-RAY DIFFRACTION	100
2.971-3.0356	0.293	138	0.2725	2602	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0356-3.1062	0.303	155	0.2633	2576	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1062-3.1838	0.3069	164	0.2554	2613	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1838-3.2698	0.2961	138	0.2514	2586	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2698-3.366	0.295	125	0.2437	2630	X-RAY DIFFRACTION	100
3.366-3.4745	0.2864	148	0.2323	2621	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4745-3.5986	0.2752	146	0.2251	2578	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5986-3.7425	0.2119	129	0.2035	2637	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7425-3.9126	0.2099	136	0.2003	2611	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9126-4.1186	0.1705	123	0.1884	2620	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1186-4.3762	0.2453	136	0.18	2599	X-RAY DIFFRACTION	99
4.3762-4.7134	0.1843	131	0.1716	2567	X-RAY DIFFRACTION	97
4.7134-5.1863	0.2352	154	0.1792	2557	X-RAY DIFFRACTION	98
5.1863-5.9337	0.2427	153	0.1848	2572	X-RAY DIFFRACTION	99
5.9337-7.4639	0.2178	131	0.2059	2638	X-RAY DIFFRACTION	100
7.4639-35.0693	0.2045	146	0.1767	2536	X-RAY DIFFRACTION	96

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.1371	0.0853	0.0013	0.0572	0.0056	0.0167	0.0279	-0.0143	-0.0772	0.296	-0.1108	0.2669	0.0888	0.1006	-0.0115	0.4236	0.035	0.06	0.202	0.0107	0.2694	18.8444	28.6349	6.8499
2	0.3845	0.0521	0.116	0.2326	0.1561	0.3561	0.1127	0.0202	0.0731	0.1948	-0.0884	0.0673	-0.021	0.0073	0	0.2697	-0.0248	0.0658	0.2318	0.0128	0.2034	20.5468	65.2301	5.0239
3	0.0051	-0.0039	0.0049	0.0172	-0.0104	-0.0021	0.0228	0.0127	-0.1212	0.1566	0.0194	0.0298	0.1473	0.0912	0	0.336	0.0238	0.0281	0.2063	-0.03	0.3909	18.6711	20.1212	0.264
4	0.1285	-0.0076	-0.133	0.0096	-0.006	0.1089	-0.0653	0.08	-0.0498	0.2214	0.0893	0.0527	0.1559	0.0229	0.0038	0.5487	0.0789	-0.0457	0.2367	-0.0354	0.3665	25.7553	2.9216	-1.7995
5	0.1731	0.1259	-0.0183	0.0894	-0.0098	-0.0772	0.0318	0.091	-0.1372	0.1775	-0.0938	0.113	0.0054	0.0415	-0.0001	0.4126	0.0938	-0.0502	0.2518	-0.0618	0.3883	26.529	-8.0375	-8.3485
6	0.1894	-0.0079	-0.0013	0.0911	-0.1176	0.2303	-0.0468	0.2372	-0.0561	0.0041	0.0104	-0.19	0.0442	0.2241	-0.0001	0.2076	0.1009	0.0358	0.4062	-0.0095	0.1697	37.0916	38.5459	-26.9025
7	0.4313	-0.1461	-0.002	0.1064	0.0283	0.4311	0.05	0.1505	0.3485	-0.1487	0.0861	-0.0066	-0.2031	0.0393	0.0658	0.2649	-0.0174	0.0164	0.4415	0.1125	0.2526	26.6001	72.9203	-27.8707
8	0.0473	-0.0336	-0.0473	0.0242	0.0099	0.037	-0.0135	0.1363	-0.1084	-0.2039	-0.0092	-0.2545	0.1537	0.2508	0.0003	0.3813	0.1013	0.002	0.4209	-0.0389	0.3248	37.7986	28.7856	-24.7137
9	0.0025	-0.0011	0.0035	0.0084	0.0041	0.0062	0.1147	0.0109	-0.0306	-0.0031	0.0536	-0.1155	0.0142	0.0201	-0	0.8862	0.2445	0.0327	0.665	-0.1691	0.7496	41.0774	-6.3436	-22.4252
10	0.197	0.0148	-0.0982	0.1229	-0.1725	0.2469	-0.0892	0.119	-0.038	0.0083	-0.0535	0.0565	0.251	0.1435	-0.2562	0.413	0.1571	0.0169	0.2552	-0.0957	0.1568	31.4506	10.6138	-23.287
11	-0.0004	-0.0007	0.0003	0.0111	0.0088	0.005	-0.0119	0.0253	-0.0226	-0.0257	-0.0448	-0.0334	0.0709	-0.0013	0	1.2811	0.3047	0.2894	0.7137	-0.07	0.8835	40.3934	-22.0255	-32.7056
12	0.0019	0.0045	0.0023	0.0086	0.0036	0.001	0.0055	-0.0452	-0.0798	-0.0194	0.0573	0.0047	0.0137	0.0053	0	1.4829	0.0951	0.113	0.7843	-0.2888	1.1627	36.7721	-34.9382	-30.0822
13	0.2206	0.2228	-0.0765	0.2216	-0.1122	0.3015	0.1746	0.3216	-0.085	-0.2058	0.0492	0.2799	0.1591	-0.1388	0.4111	0.3862	0.022	-0.2177	0.4435	-0.169	0.4469	0.9527	27.8697	-28.2683
14	0.3516	0.0077	0.1367	0.1672	0.0269	0.2511	0.0937	0.1746	0.2388	0.0542	-0.0532	0.2055	0.0453	-0.09	0.0256	0.0226	0.067	0.0095	0.3344	0.1211	0.4406	-4.6161	65.2013	-17.3903
15	0.1286	0.034	-0.1009	0.0184	0.0047	0.1707	0.0719	0.0968	-0.0961	-0.1869	0.0537	0.1009	0.1071	0.0109	0.0588	0.3631	0.0086	-0.1428	0.4024	-0.1054	0.4595	4.4137	23.8563	-27.0441
16	0.0016	0.0085	0.0005	-0.0006	0.0012	0.0064	-0.0623	0.0155	0.0295	-0.042	-0.0936	0.0668	0.0596	0.1023	-0	0.9298	0.093	-0.297	0.6027	-0.3027	0.8493	10.8888	-15.2407	-29.2931
17	0.3565	0.2904	0.0335	0.2283	0.0795	0.3337	0.1151	0.383	-0.0611	-0.0396	0.0432	0.2632	0.1782	-0.0148	0.2834	0.3709	0.0282	-0.1642	0.2886	-0.1921	0.2707	14.7018	12.165	-20.2271
18	0.0016	0.0017	-0.0063	0.0045	-0.0014	-0.0003	0.0468	0.0039	-0.1963	0.0372	-0.0814	-0.0656	0.1472	0.0883	-0	1.626	-0.0919	-0.3223	0.6206	-0.1439	1.2607	13.8239	-31.6464	-22.0632

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 4 through 96 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 97 through 285 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 286 through 325 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 335 through 408 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 409 through 509 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'C' and (resid 4 through 119 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'C' and (resid 120 through 270 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 271 through 325 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'D' and (resid 335 through 356 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'D' and (resid 357 through 466 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'D' and (resid 467 through 492 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 493 through 509 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'E' and (resid 4 through 96 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'E' and (resid 97 through 270 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'E' and (resid 271 through 325 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'F' and (resid 335 through 371 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'F' and (resid 372 through 466 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'F' and (resid 467 through 509 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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