登録構造単位 | A: Capsid protein VP1 B: Capsid protein VP2 C: Capsid protein VP3 D: Capsid protein VP4
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 80,716 | 4 |
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ポリマ- | 80,716 | 4 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 1,009 | 56 |
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|
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1 | A: Capsid protein VP1 B: Capsid protein VP2 C: Capsid protein VP3 D: Capsid protein VP4
x 60
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 4,842,974 | 240 |
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ポリマ- | 4,842,974 | 240 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 3,243 | 180 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | point symmetry operation | | | 59 |
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2 |
- 登録構造と同一
- icosahedral asymmetric unit
タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 |
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3 | A: Capsid protein VP1 B: Capsid protein VP2 C: Capsid protein VP3 D: Capsid protein VP4
x 5
![](data/pdb/img_asb/4iv3_3.jpg) - icosahedral pentamer
- 404 kDa, 20 ポリマー
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 403,581 | 20 |
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ポリマ- | 403,581 | 20 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 270 | 15 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | point symmetry operation | | | 4 |
|
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4 | A: Capsid protein VP1 B: Capsid protein VP2 C: Capsid protein VP3 D: Capsid protein VP4
x 6
![](data/pdb/img_asb/4iv3_4.jpg) - icosahedral 23 hexamer
- 484 kDa, 24 ポリマー
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 484,297 | 24 |
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ポリマ- | 484,297 | 24 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 324 | 18 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 1 | point symmetry operation | | | 5 |
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5 |
![](data/pdb/img_asb/4iv3_5.jpg) - 登録構造と同一(異なる座標系)
- icosahedral asymmetric unit, std point frame
タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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transform to point frame | | | 1 |
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6 | A: Capsid protein VP1 B: Capsid protein VP2 C: Capsid protein VP3 D: Capsid protein VP4
x 15
![](data/pdb/img_asb/4iv3_6.jpg) - crystal asymmetric unit, crystal frame
- 1.21 MDa, 60 ポリマー
| 分子量 (理論値) | 分子数 |
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合計 (水以外) | 1,210,743 | 60 |
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ポリマ- | 1,210,743 | 60 |
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非ポリマー | 0 | 0 |
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水 | 811 | 45 |
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タイプ | 名称 | 対称操作 | 数 |
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identity operation | 1_555 | x,y,z | 2 | point symmetry operation | | | 14 |
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単位格子 | Length a, b, c (Å) | 328.020, 341.490, 363.370 |
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Angle α, β, γ (deg.) | 90.00, 90.00, 90.00 |
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Int Tables number | 23 |
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Space group name H-M | I222 |
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対称性 | 点対称性: (シェーンフリース記号: I (正20面体型対称)) |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: ID | Code | Matrix |
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1 | given(1), (1), (1)2 | generate(0.5, -0.809017, 0.309017), (0.809017, 0.309017, -0.5), (0.309017, 0.5, 0.809017)3 | generate(-0.309017, -0.5, 0.809017), (0.5, -0.809017, -0.309017), (0.809017, 0.309017, 0.5)4 | generate(-0.309017, 0.5, 0.809017), (-0.5, -0.809017, 0.309017), (0.809017, -0.309017, 0.5)5 | generate(0.5, 0.809017, 0.309017), (-0.809017, 0.309017, 0.5), (0.309017, -0.5, 0.809017)6 | generate(1), (1), (1)7 | generate(0.309017, 0.5, 0.809017), (0.5, -0.809017, 0.309017), (0.809017, 0.309017, -0.5)8 | generate(0.809017, 0.309017, 0.5), (-0.309017, -0.5, 0.809017), (0.5, -0.809017, -0.309017)9 | generate(0.809017, -0.309017, 0.5), (-0.309017, 0.5, 0.809017), (-0.5, -0.809017, 0.309017)10 | generate(0.309017, -0.5, 0.809017), (0.5, 0.809017, 0.309017), (-0.809017, 0.309017, 0.5)11 | generate(1), (1), (1)12 | generate(0.809017, 0.309017, -0.5), (0.309017, 0.5, 0.809017), (0.5, -0.809017, 0.309017)13 | generate(0.5, -0.809017, -0.309017), (0.809017, 0.309017, 0.5), (-0.309017, -0.5, 0.809017)14 | generate(-0.5, -0.809017, 0.309017), (0.809017, -0.309017, 0.5), (-0.309017, 0.5, 0.809017)15 | generate(-0.809017, 0.309017, 0.5), (0.309017, -0.5, 0.809017), (0.5, 0.809017, 0.309017) | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |
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