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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4ilr | ||||||
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タイトル | Recognition and Cleavage of a non-structured CRISPR RNA by its Processing Endoribonuclease Cas6 | ||||||
![]() | CRISPR-associated endoribonuclease Cas6 2 | ||||||
![]() | HYDROLASE / RRM / RNA cleavage / RNA | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Shao, Y. / Li, H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Recognition and cleavage of a nonstructured CRISPR RNA by its processing endoribonuclease Cas6. 著者: Shao, Y. / Li, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 66.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 49.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 424.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 431.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 32684.143 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q97WV8, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 65.28 % |
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結晶化 | 温度: 303 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.6 詳細: 200mM MgCl2, 100mM Tris-Cl (pH 7.6), 32% PEG 400., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 300 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2012年4月21日 |
放射 | モノクロメーター: Si crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9792 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3→34 Å / Num. all: 10085 / Num. obs: 8986 / % possible obs: 89.1 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 28.2 % / Biso Wilson estimate: 50 Å2 / Rsym value: 0.084 / Net I/σ(I): 42.8 |
反射 シェル | 解像度: 3→3.1 Å / 冗長度: 15.6 % / Mean I/σ(I) obs: 3.5 / Num. unique all: 500 / Rsym value: 0.427 / % possible all: 34.2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.088→26.772 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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