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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4hwd | ||||||
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タイトル | Crystal structure of ATBAG2 | ||||||
![]() | BAG family molecular chaperone regulator 2 | ||||||
![]() | APOPTOSIS / three helix bundle / co-chaperone | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Shen, Y. / Fang, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insight into plant programmed cell death mediated by BAG proteins in Arabidopsis thaliana. 著者: Fang, S. / Li, L. / Cui, B. / Men, S. / Shen, Y. / Yang, X. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 113.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 89.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 444 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 449.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9920.485 Da / 分子数: 3 / 断片: BAG domain (UNP residues 129-214) / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: At5g62100, BAG2, MTG10.13 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.65 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.2 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | |||||||||
検出器 | タイプ: RAYONIX MX-225 / 検出器: CCD / 日付: 2010年2月3日 | |||||||||
放射 | モノクロメーター: double crystal Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||
放射波長 |
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反射 | 解像度: 2.312→35.711 Å / Num. all: 13096 / Num. obs: 12982 / % possible obs: 98.6 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 | |||||||||
反射 シェル | 解像度: 2.312→2.35 Å / % possible all: 95.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.61 Å / VDWプローブ半径: 0.9 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 30.304 Å2 / ksol: 0.351 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.312→35.711 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Origin x: -11.6405 Å / Origin y: -2.0873 Å / Origin z: 23.6578 Å
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精密化 TLSグループ | Selection details: all |