protein secretion by the type III secretion system 類似検索 - 分子機能
Arc Repressor Mutant, subunit A - #120 / HopA1 effector protein / HopA1 effector protein family / Tir chaperone protein (CesT) family / Tir chaperone protein (CesT) family / Yope Regulator; Chain: A, - #10 / Yope Regulator; Chain: A, / Arc Repressor Mutant, subunit A / Helix non-globular / Special ...Arc Repressor Mutant, subunit A - #120 / HopA1 effector protein / HopA1 effector protein family / Tir chaperone protein (CesT) family / Tir chaperone protein (CesT) family / Yope Regulator; Chain: A, - #10 / Yope Regulator; Chain: A, / Arc Repressor Mutant, subunit A / Helix non-globular / Special / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
Type III effector HopA1 / Type III chaperone protein ShcA 類似検索 - 構成要素
手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
-
データ収集
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
反射
解像度: 1.56→58.74 Å / Num. obs: 34556
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0117
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.56→58.74 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.963 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.957 / SU B: 1.586 / SU ML: 0.058 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.082 / ESU R Free: 0.081 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22973
1820
5 %
RANDOM
Rwork
0.2095
-
-
-
obs
0.21051
34556
99.95 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK