PDB-4g4e: Crystal structure of the L88A mutant of HslV from Escherichia coli

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4g4e

タイトル

Crystal structure of the L88A mutant of HslV from Escherichia coli

要素

ATP-dependent protease subunit HslV

キーワード

HYDROLASE / ATP-dependent Protease / HslU ATPase / HslV protease / HslVU / Pore Motif

機能・相同性

機能・相同性情報

HslU-HslV peptidase / protein denaturation / HslUV protease complex / proteasome core complex / threonine-type endopeptidase activity / proteolysis involved in protein catabolic process / cellular response to heat / response to heat / protein domain specific binding / magnesium ion binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Escherichia coli (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.888 Å

データ登録者

Lee, J.W. / Park, E. / Yoo, H.M. / Ha, B.H. / An, J.Y. / Jeon, Y.J. / Seol, J.H. / Eom, S.H. / Chung, C.H.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2013
タイトル: Structural Alteration in the Pore Motif of the Bacterial 20S Proteasome Homolog HslV Leads to Uncontrolled Protein Degradation
著者: Park, E. / Lee, J.W. / Yoo, H.M. / Ha, B.H. / An, J.Y. / Jeon, Y.J. / Seol, J.H. / Eom, S.H. / Chung, C.H.

履歴

登録	2012年7月16日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2013年6月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年8月14日	Group: Database references
改定 1.2	2017年11月15日	Group: Advisory / Refinement description / カテゴリ: pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / software
改定 1.3	2023年11月8日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4g4e.cif.gz	750.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4g4e.ent.gz	631.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4g4e.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4g4e_validation.pdf.gz	523 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4g4e_full_validation.pdf.gz	590.3 KB	表示
XML形式データ	4g4e_validation.xml.gz	73.4 KB	表示
CIF形式データ	4g4e_validation.cif.gz	95.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g4/4g4e ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g4/4g4e	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1e94S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1hqy-2 1ht2-3 1ht2-4 1e94-2 1ht1-2 2z3b-2 1g3k-1 2z3a-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#80 - 2006年8月 AAA+プロテアーゼ (AAA+ Proteases) 類似性 (7) #176 - 2014年8月ダイニン (Dynein) 類似性 (6) #166 - 2013年10月プロテアソーム (Proteasome) 類似性 (5) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (5)

登録構造単位

A: ATP-dependent protease subunit HslV

B: ATP-dependent protease subunit HslV

C: ATP-dependent protease subunit HslV

D: ATP-dependent protease subunit HslV

E: ATP-dependent protease subunit HslV

F: ATP-dependent protease subunit HslV

G: ATP-dependent protease subunit HslV

H: ATP-dependent protease subunit HslV

I: ATP-dependent protease subunit HslV

J: ATP-dependent protease subunit HslV

K: ATP-dependent protease subunit HslV

L: ATP-dependent protease subunit HslV

226 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	76.275, 167.122, 90.313
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 105.86, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	CHAIN A AND (RESSEQ 1:174 )
2	1	CHAIN B AND (RESSEQ 1:174 )
3	1	CHAIN C AND (RESSEQ 1:174 )
4	1	CHAIN D AND (RESSEQ 1:174 )
5	1	CHAIN E AND (RESSEQ 1:174 )
6	1	CHAIN F AND (RESSEQ 1:174 )
7	1	CHAIN G AND (RESSEQ 1:174 )
8	1	CHAIN H AND (RESSEQ 1:174 )
9	1	CHAIN I AND (RESSEQ 1:174 )
10	1	CHAIN J AND (RESSEQ 1:174 )
11	1	CHAIN K AND (RESSEQ 1:174 )
12	1	CHAIN L AND (RESSEQ 1:174 )

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: THR / Beg label comp-ID: THR / End auth comp-ID: LYS / End label comp-ID: LYS / Auth seq-ID: 1 - 174 / Label seq-ID: 1 - 174

Dom-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	CHAIN A AND (RESSEQ 1:174 )	A	A
2	CHAIN B AND (RESSEQ 1:174 )	B	B
3	CHAIN C AND (RESSEQ 1:174 )	C	C
4	CHAIN D AND (RESSEQ 1:174 )	D	D
5	CHAIN E AND (RESSEQ 1:174 )	E	E
6	CHAIN F AND (RESSEQ 1:174 )	F	F
7	CHAIN G AND (RESSEQ 1:174 )	G	G
8	CHAIN H AND (RESSEQ 1:174 )	H	H
9	CHAIN I AND (RESSEQ 1:174 )	I	I
10	CHAIN J AND (RESSEQ 1:174 )	J	J
11	CHAIN K AND (RESSEQ 1:174 )	K	K
12	CHAIN L AND (RESSEQ 1:174 )	L	L

#1: タンパク質	ATP-dependent protease subunit HslV / Heat shock protein HslV 分子量: 18873.482 Da / 分子数: 12 / 変異: L88A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 遺伝子: hslV / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A7B8, HslU-HslV peptidase

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.44 Å³/Da / 溶媒含有率: 49.69 %
結晶化	温度: 294 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 0.1M Tris-HCl, 28%(v/v) PEG MME550, 0.2M ammonium formate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 110 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: PAL/PLS / ビームライン: 6C1 / 波長: 1.24 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2009年12月8日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.24 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.888→50 Å / Num. all: 45242 / Num. obs: 45193 / % possible obs: 92.7 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0
反射シェル	解像度: 2.9→2.95 Å / % possible all: 92.7

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX	1.8_1069	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 開始モデル: 1.0E+94 / 解像度: 2.888→49.752 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0 / FOM work R set: 0.7455 / SU ML: 0.47 / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 32.22 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2934	2291	5.07 %	RANDOM
R_work	0.2582	-	-	-
obs	0.2589	45177	92.65 %	-
all	-	45242	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 395.19 Å² / B_iso mean: 79.0882 Å² / B_iso min: 8.38 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.888→49.752 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	15432	0	0	0	15432

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.1	16140
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.13	21804
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr		2568
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr		2820
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d		5880

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.092
1	2	B	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.092
1	3	C	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.085
1	4	D	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.083
1	5	E	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.097
1	6	F	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.08
1	7	G	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.065
1	8	H	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.079
1	9	I	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.078
1	10	J	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.081
1	11	K	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.101
1	12	L	1328	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.078

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 16

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.8879-2.9507	0.4266	119	0.3321	1919	2038	67
2.9507-3.0193	0.4476	129	0.3386	2770	2899	96
3.0193-3.0948	0.3854	155	0.3179	2772	2927	96
3.0948-3.1785	0.3887	135	0.313	2785	2920	96
3.1785-3.272	0.3099	153	0.3043	2725	2878	95
3.272-3.3776	0.3867	139	0.292	2739	2878	95
3.3776-3.4983	0.2917	143	0.2786	2752	2895	94
3.4983-3.6383	0.35	144	0.2791	2686	2830	94
3.6383-3.8038	0.3087	156	0.2634	2685	2841	93
3.8038-4.0043	0.2812	154	0.2524	2655	2809	93
4.0043-4.2551	0.3143	148	0.2439	2669	2817	92
4.2551-4.5834	0.2283	154	0.231	2612	2766	91
4.5834-5.0442	0.2369	139	0.2245	2650	2789	91
5.0442-5.7732	0.2734	122	0.2453	2684	2806	92
5.7732-7.27	0.3317	147	0.2653	2860	3007	98
7.27-49.7595	0.2304	154	0.2055	2923	3077	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0093	0.0044	-0.0076	0.0108	-0.0139	0.0186	-0.0644	0.0237	-0.0228	0.0228	-0.0222	-0.0555	-0.0394	0.0123	-0.0271	0.1142	-0.0227	0.0303	0.0403	-0.019	0.1997	23.6574	-165.0857	28.1414
2	0.0761	-0.0021	-0.068	0.0602	0.0375	0.0833	-0.0825	0.0062	-0.03	0.0472	-0.0482	-0.1103	0.0156	0.024	-0.1561	0.2542	0.0166	0.0164	0.0439	0.0492	0.324	29.4369	-177.2488	21.0382
3	0.0007	-0.0001	-0.0001	0.0011	-0.0008	0.0007	0.0015	-0.0246	0.0109	0.0067	0.011	0.0002	0.049	0.0224	-0.0002	0.4304	0.071	0.1655	0.4853	-0.0105	0.7551	40.9232	-169.3412	17.6732
4	0.0005	-0.0014	-0.0017	0.0054	0.0029	0.0035	0.0288	0.0043	0.0103	-0.0138	-0.0024	0.0093	0.0148	0.0275	0	0.8997	0.0246	0.2241	0.8092	0.0615	1.0465	40.2384	-159.799	15.4586
5	0.0064	0.0042	-0.004	0.0041	-0.0016	0.0031	-0.0082	0.0066	0.0004	0.0061	-0.0068	0.0078	-0.0061	0.0051	-0.0003	1.0002	0.0664	0.0179	1.0451	-0.0521	1.0265	34.008	-172.708	4.734
6	0.0671	-0.0062	-0.0565	0.3212	0.0843	0.0611	-0.0359	-0.0431	-0.0659	0.1332	-0.0731	-0.083	-0.0344	-0.0223	-0.2027	0.2564	-0.0096	0.0002	-0.0921	0.1224	0.0486	21.0978	-166.7337	23.7513
7	0.0066	0.0109	-0.0117	0.0659	-0.0352	0.0532	-0.0617	-0.0753	-0.1029	0.0159	0.0183	0.004	0.0533	0.0477	-0.0126	0.0936	-0.0513	0.0547	0.1058	0.2272	0.2711	20.9376	-146.757	6.2572
8	0.0218	0.003	-0.0007	0.0012	-0.0023	0.011	-0.0293	-0.0142	-0.0174	0.0084	-0.0248	-0.0483	-0.0076	0.0309	-0.034	0.1616	0.0139	-0.0742	0.3752	0.2718	0.3527	35.9581	-145.554	5.892
9	0.0006	-0.0002	-0.0004	0.0057	0.0047	0.0041	0.0324	0.0295	-0.0057	-0.0052	0.0225	0.0052	-0.0165	0.0389	-0.0003	0.5069	0.0042	0.0124	0.5901	0.0761	0.7111	41.8867	-143.8668	-4.5936
10	0.0001	0.0002	0	0.0018	0.0005	0	-0.0067	0.001	-0.0012	0.0011	-0.0131	0.0057	0.0053	0.0025	-0.0003	1.1984	0.0433	-0.0111	1.2825	-0.0867	1.258	34.154	-159.237	-3.117
11	0.1562	0.0895	-0.0475	0.1831	0.0356	0.2982	-0.1471	0.009	-0.0059	-0.0974	-0.0381	0.0088	-0.0525	0.005	-0.3582	0.1733	-0.0172	-0.0013	0.0891	0.065	0.2891	20.4692	-141.326	-0.2833
12	0.0034	0.0018	0.0039	0.0149	0.0134	0.0298	0.0254	-0.0462	0.0173	-0.0114	-0.0326	0.0051	0.0135	-0.0671	0.0905	0.3437	-0.1532	0.1749	0.1325	-0.1666	0.2299	-1.8903	-193.9563	16.6265
13	0.0129	-0.0002	-0.0034	0.0127	0.009	0.0205	-0.0162	-0.0064	0.0066	0.0406	0.0134	-0.0014	-0.0301	-0.0378	-0.0032	0.3639	0.192	0.0021	0.3521	0.0745	0.6964	-14.1544	-199.098	5.3712
14	0.0016	0.001	0.0031	0.008	0.0012	0.006	-0.014	0.0005	-0.0041	0.0036	-0.0184	-0.0074	0.0015	0.0024	-0.0007	1.8451	-0.0069	-0.0365	1.8215	0.0375	1.8076	-6.065	-188.083	-1.827
15	0.0523	0.0239	0.0199	0.0124	-0.0024	0.0429	0.0433	-0.0637	-0.012	0.0291	0.0417	-0.037	-0.0325	0.0986	0.1288	0.3072	-0.0649	0.1009	0.1102	-0.1626	0.1923	4.5018	-200.7423	15.1596
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60	0.0837	-0.0058	-0.0363	0.0574	-0.0431	0.0525	-0.0172	0.0904	-0.0253	-0.1009	0.0227	-0.0061	0.0664	-0.0077	0.0165	0.2899	0.1686	-0.0467	0.6443	-0.1669	0.1727	12.5195	-190.7797	-46
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62	0.0049	0.0013	0.0013	0.0032	-0.0014	0.0044	-0.0445	-0.0023	-0.0043	-0.017	-0.0188	0.0102	0.0097	0.008	0.0001	0.4749	0.0149	-0.155	0.6075	-0.1583	0.617	-7.6953	-167.7118	-39.9958
63	0.0013	0.002	-0.0017	0.0039	-0.001	0.0053	0.0015	0.0146	0.0235	-0.001	-0.0218	0.0063	-0.0047	-0.0255	0.0005	0.5783	0.0054	0.0193	0.7397	-0.0667	0.7263	-14.6709	-159.9709	-34.8616
64	0.0014	0.0003	0.0018	0.0002	0.0004	0.0022	-0.0008	0.0006	0.0055	-0.0011	-0.0002	-0.0015	0.0071	0.008	0	0.9977	-0.078	-0.021	1.0918	-0.0043	1.015	-4.19	-171.966	-27.557
65	0.0379	0.0417	-0.0114	0.0508	-0.0046	0.1086	-0.0645	0.1407	0.0291	-0.1424	0.0149	0.0513	-0.1309	0.1078	0.0038	0.4858	0.1075	-0.1986	0.7904	-0.048	0.1641	5.9747	-156.1441	-41.4384

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	CHAIN B AND (RESID 1 : 16 )	B	1 - 16
2	X-RAY DIFFRACTION	2	CHAIN B AND (RESID 17 : 52 )	B	17 - 52
3	X-RAY DIFFRACTION	3	CHAIN B AND (RESID 53 : 66 )	B	53 - 66
4	X-RAY DIFFRACTION	4	CHAIN B AND (RESID 67 : 83 )	B	67 - 83
5	X-RAY DIFFRACTION	5	CHAIN B AND (RESID 84 : 92 )	B	84 - 92
6	X-RAY DIFFRACTION	6	CHAIN B AND (RESID 93 : 174 )	B	93 - 174
7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN A AND (RESID 1 : 33 )	A	1 - 33
8	X-RAY DIFFRACTION	8	CHAIN A AND (RESID 34 : 66 )	A	34 - 66
9	X-RAY DIFFRACTION	9	CHAIN A AND (RESID 67 : 83 )	A	67 - 83
10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN A AND (RESID 84 : 92 )	A	84 - 92
11	X-RAY DIFFRACTION	11	CHAIN A AND (RESID 93 : 174 )	A	93 - 174
12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN C AND (RESID 1 : 52 )	C	1 - 52
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN C AND (RESID 53 : 83 )	C	53 - 83
14	X-RAY DIFFRACTION	14	CHAIN C AND (RESID 84 : 92 )	C	84 - 92
15	X-RAY DIFFRACTION	15	CHAIN C AND (RESID 93 : 174 )	C	93 - 174
16	X-RAY DIFFRACTION	16	CHAIN D AND (RESID 1 : 41 )	D	1 - 41
17	X-RAY DIFFRACTION	17	CHAIN D AND (RESID 42 : 66 )	D	42 - 66
18	X-RAY DIFFRACTION	18	CHAIN D AND (RESID 67 : 83 )	D	67 - 83
19	X-RAY DIFFRACTION	19	CHAIN D AND (RESID 84 : 92 )	D	84 - 92
20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN D AND (RESID 93 : 174 )	D	93 - 174
21	X-RAY DIFFRACTION	21	CHAIN E AND (RESID 1 : 41 )	E	1 - 41
22	X-RAY DIFFRACTION	22	CHAIN E AND (RESID 42 : 66 )	E	42 - 66
23	X-RAY DIFFRACTION	23	CHAIN E AND (RESID 67 : 92 )	E	67 - 92
24	X-RAY DIFFRACTION	24	CHAIN E AND (RESID 93 : 174 )	E	93 - 174
25	X-RAY DIFFRACTION	25	CHAIN F AND (RESID 1 : 41 )	F	1 - 41
26	X-RAY DIFFRACTION	26	CHAIN F AND (RESID 42 : 66 )	F	42 - 66
27	X-RAY DIFFRACTION	27	CHAIN F AND (RESID 67 : 83 )	F	67 - 83
28	X-RAY DIFFRACTION	28	CHAIN F AND (RESID 84 : 92 )	F	84 - 92
29	X-RAY DIFFRACTION	29	CHAIN F AND (RESID 93 : 174 )	F	93 - 174
30	X-RAY DIFFRACTION	30	CHAIN G AND (RESID 1 : 33 )	G	1 - 33
31	X-RAY DIFFRACTION	31	CHAIN G AND (RESID 34 : 52 )	G	34 - 52
32	X-RAY DIFFRACTION	32	CHAIN G AND (RESID 53 : 66 )	G	53 - 66
33	X-RAY DIFFRACTION	33	CHAIN G AND (RESID 67 : 83 )	G	67 - 83
34	X-RAY DIFFRACTION	34	CHAIN G AND (RESID 84 : 92 )	G	84 - 92
35	X-RAY DIFFRACTION	35	CHAIN G AND (RESID 93 : 174 )	G	93 - 174
36	X-RAY DIFFRACTION	36	CHAIN H AND (RESID 1 : 33 )	H	1 - 33
37	X-RAY DIFFRACTION	37	CHAIN H AND (RESID 34 : 52 )	H	34 - 52
38	X-RAY DIFFRACTION	38	CHAIN H AND (RESID 53 : 66 )	H	53 - 66
39	X-RAY DIFFRACTION	39	CHAIN H AND (RESID 67 : 83 )	H	67 - 83
40	X-RAY DIFFRACTION	40	CHAIN H AND (RESID 84 : 92 )	H	84 - 92
41	X-RAY DIFFRACTION	41	CHAIN H AND (RESID 93 : 174 )	H	93 - 174
42	X-RAY DIFFRACTION	42	CHAIN I AND (RESID 1 : 33 )	I	1 - 33
43	X-RAY DIFFRACTION	43	CHAIN I AND (RESID 34 : 52 )	I	34 - 52
44	X-RAY DIFFRACTION	44	CHAIN I AND (RESID 53 : 66 )	I	53 - 66
45	X-RAY DIFFRACTION	45	CHAIN I AND (RESID 67 : 83 )	I	67 - 83
46	X-RAY DIFFRACTION	46	CHAIN I AND (RESID 84 : 92 )	I	84 - 92
47	X-RAY DIFFRACTION	47	CHAIN I AND (RESID 93 : 125 )	I	93 - 125
48	X-RAY DIFFRACTION	48	CHAIN I AND (RESID 126 : 174 )	I	0
49	X-RAY DIFFRACTION	49	CHAIN J AND (RESID 1 : 33 )	J	1 - 33
50	X-RAY DIFFRACTION	50	CHAIN J AND (RESID 34 : 52 )	J	34 - 52
51	X-RAY DIFFRACTION	51	CHAIN J AND (RESID 53 : 66 )	J	53 - 66
52	X-RAY DIFFRACTION	52	CHAIN J AND (RESID 67 : 83 )	J	67 - 83
53	X-RAY DIFFRACTION	53	CHAIN J AND (RESID 84 : 92 )	J	84 - 92
54	X-RAY DIFFRACTION	54	CHAIN J AND (RESID 93 : 125 )	J	93 - 125
55	X-RAY DIFFRACTION	55	CHAIN J AND (RESID 126 : 174 )	J	0
56	X-RAY DIFFRACTION	56	CHAIN K AND (RESID 1 : 41 )	K	1 - 41
57	X-RAY DIFFRACTION	57	CHAIN K AND (RESID 42 : 66 )	K	42 - 66
58	X-RAY DIFFRACTION	58	CHAIN K AND (RESID 67 : 83 )	K	67 - 83
59	X-RAY DIFFRACTION	59	CHAIN K AND (RESID 84 : 92 )	K	84 - 92
60	X-RAY DIFFRACTION	60	CHAIN K AND (RESID 93 : 174 )	K	93 - 174
61	X-RAY DIFFRACTION	61	CHAIN L AND (RESID 1 : 41 )	L	1 - 41
62	X-RAY DIFFRACTION	62	CHAIN L AND (RESID 42 : 66 )	L	42 - 66
63	X-RAY DIFFRACTION	63	CHAIN L AND (RESID 67 : 83 )	L	67 - 83
64	X-RAY DIFFRACTION	64	CHAIN L AND (RESID 84 : 92 )	L	84 - 92
65	X-RAY DIFFRACTION	65	CHAIN L AND (RESID 93 : 174 )	L	93 - 174

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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