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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fxc | |||||||||
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タイトル | TERTIARY STRUCTURE OF [2FE-2S] FERREDOXIN FROM SPIRULINA PLATENSIS REFINED AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: STRUCTURAL COMPARISONS OF PLANT-TYPE FERREDOXINS AND AN ELECTROSTATIC POTENTIAL ANALYSIS | |||||||||
![]() | FERREDOXIN | |||||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Fukuyama, K. / Tsukihara, T. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Tertiary structure of [2Fe-2S] ferredoxin from Spirulina platensis refined at 2.5 A resolution: structural comparisons of plant-type ferredoxins and an electrostatic potential analysis. 著者: Fukuyama, K. / Ueki, N. / Nakamura, H. / Tsukihara, T. / Matsubara, H. #1: ![]() タイトル: X-Ray Analysis of a (2Fe-2S) Ferredoxin from Spirulina Platensis. Main Chain Fold and Location of Side Chains at 2.5 Angstroms Resolution 著者: Tsukihara, T. / Fukuyama, K. / Nakamura, M. / Katsube, Y. / Tanaka, N. / Kakudo, M. / Wada, K. / Hase, T. / Matsubara, H. #2: ![]() タイトル: Structure of S. Platensis (2Fe-2S) Ferredoxin and Evolution of Chloroplast-Type Ferredoxins 著者: Fukuyama, K. / Hase, T. / Matsumoto, S. / Tsukihara, T. / Katsube, Y. / Tanaka, N. / Kakudo, M. / Wada, K. / Matsubara, H. #3: ![]() タイトル: X-Ray Analysis of Ferredoxin from Spirulina Platensis. II. Chelate Structure of Active Center 著者: Tsukihara, T. / Fukuyama, K. / Tahara, H. / Katsube, Y. / Matsuura, Y. / Tanaka, N. / Kakudo, M. / Wada, K. / Matsubara, H. #5: ![]() タイトル: Location of the Iron-Sulfur Cluster in Spirulina Platensis Ferredoxin by X-Ray Analysis 著者: Ogawa, K. / Tsukihara, T. / Tahara, H. / Katsube, Y. / Matsu-Ura, Y. / Tanaka, N. / Kakudo, M. / Wada, K. / Matsubara, H. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 31 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 20.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10506.314 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-FES / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.28 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.15 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 3 ℃ / pH: 7.5 / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 31.3 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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