登録情報 データベース : PDB / ID : 4fth 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of NtrC4 DNA-binding domain bound to double-stranded DNA 要素5'-D(*AP*CP*TP*TP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*TP*TP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*GP*CP*AP*T)-3'5'-D(P*GP*AP*TP*GP*CP*AP*TP*TP*TP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*TP*TP*GP*CP*AP*A)-3'Transcriptional regulator (NtrC family) 詳細キーワード TRANSCRIPTION REGULATOR/DNA / sigma-54 / transcriptional activator / DNA-binding domain / NtrC / Fis / helix-turn-helix / DNA-binding / TRANSCRIPTION REGULATOR-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
phosphorelay signal transduction system / sequence-specific DNA binding / regulation of DNA-templated transcription / ATP hydrolysis activity / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Sigma-54 interaction domain ATP-binding region A signature. / Sigma-54 interaction domain, ATP-binding site 1 / Sigma-54 interaction domain profile. / Sigma-54 interaction domain / RNA polymerase sigma factor 54 interaction domain / DNA binding HTH domain, Fis-type / Bacterial regulatory protein, Fis family / Response regulator receiver domain / cheY-homologous receiver domain / Signal transduction response regulator, receiver domain ... Sigma-54 interaction domain ATP-binding region A signature. / Sigma-54 interaction domain, ATP-binding site 1 / Sigma-54 interaction domain profile. / Sigma-54 interaction domain / RNA polymerase sigma factor 54 interaction domain / DNA binding HTH domain, Fis-type / Bacterial regulatory protein, Fis family / Response regulator receiver domain / cheY-homologous receiver domain / Signal transduction response regulator, receiver domain / Response regulatory domain profile. / CheY-like superfamily / Homeodomain-like / Homeobox-like domain superfamily / Arc Repressor Mutant, subunit A / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Transcriptional regulator (NtrC family) 類似検索 - 構成要素生物種 Aquifex aeolicus (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 3.004 Å 詳細データ登録者 Vidangos, N.K. / Heideker, J. / Lyubimov, A.Y. / Lamers, M. / Huo, Y. / Pelton, J.G. / Ton, J. / Gralla, J.D. / Kuriyan, J. / Berger, J.M. / Wemmer, D.E. 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2014タイトル : DNA Recognition by a sigma (54) Transcriptional Activator from Aquifex aeolicus.著者 : Vidangos, N.K. / Heideker, J. / Lyubimov, A. / Lamers, M. / Huo, Y. / Pelton, J.G. / Ton, J. / Gralla, J. / Berger, J. / Wemmer, D.E. 履歴 登録 2012年6月27日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2012年8月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年10月8日 Group : Database references改定 1.2 2014年11月12日 Group : Database references改定 1.3 2023年9月13日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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