登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fnt |
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タイトル | Crystal structure of GH36 alpha-galactosidase AgaA A355E D548N from Geobacillus stearothermophilus in complex with raffinose |
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要素 | Alpha-galactosidase AgaA |
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キーワード | HYDROLASE / Glycoside Hydrolase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
stachyose metabolic process / raffinose catabolic process / alpha-galactosidase / alpha-galactosidase activity / protein homotetramerization類似検索 - 分子機能 alpha-galactosidase from lactobacil brevis / Glycosyl hydrolase family 36, N-terminal / Glycosyl hydrolase family 36, C-terminal / Alpha-galactosidase, N-terminal domain superfamily / Glycosyl hydrolase family 36 C-terminal domain / Glycosyl hydrolase family 36 N-terminal domain / Glycoside hydrolase family 36 / Melibiase / Glycoside hydrolase family 27/36, conserved site / Alpha-galactosidase signature. ...alpha-galactosidase from lactobacil brevis / Glycosyl hydrolase family 36, N-terminal / Glycosyl hydrolase family 36, C-terminal / Alpha-galactosidase, N-terminal domain superfamily / Glycosyl hydrolase family 36 C-terminal domain / Glycosyl hydrolase family 36 N-terminal domain / Glycoside hydrolase family 36 / Melibiase / Glycoside hydrolase family 27/36, conserved site / Alpha-galactosidase signature. / Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta / Distorted Sandwich / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Geobacillus stearothermophilus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Merceron, R. / Foucault, M. / Haser, R. / Mattes, R. / Watzlawick, H. / Gouet, P. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2012 タイトル: The molecular mechanism of the thermostable alpha-galactosidases AgaA and AgaB explained by X-ray crystallography and mutational studies 著者: Merceron, R. / Foucault, M. / Haser, R. / Mattes, R. / Watzlawick, H. / Gouet, P. |
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履歴 | 登録 | 2012年6月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年10月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年2月20日 | Group: Database references |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.type / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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