解像度: 1.9→2 Å / Rmerge(I) obs: 0.633 / Mean I/σ(I) obs: 3.4 / % possible all: 92.1
-
解析
ソフトウェア
名称
分類
XDS
データスケーリング
REFMAC
精密化
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
REFMAC
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.91→10 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.968 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.958 / SU B: 7.739 / SU ML: 0.1 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.137 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.20481
1355
5 %
RANDOM
Rwork
0.1636
-
-
-
all
0.169
25744
-
-
obs
0.1657
25744
99.74 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 37.413 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
1.51 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
1.51 Å2
0 Å2
3-
-
-
-3.01 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.91→10 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
2733
0
78
230
3041
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.011
0.02
2884
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.673
2.017
3888
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
5.591
5
340
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
40.129
24.39
123
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
16.181
15
498
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
12.754
15
13
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.102
0.2
429
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.006
0.021
2110
X-RAY DIFFRACTION
r_rigid_bond_restr
2.249
3
2884
X-RAY DIFFRACTION
r_sphericity_free
30.817
5
55
X-RAY DIFFRACTION
r_sphericity_bonded
12.182
5
2986
LS精密化 シェル
解像度: 1.906→1.954 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.27
86
-
Rwork
0.219
1584
-
obs
-
-
98.58 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 14.808 Å / Origin y: 4.984 Å / Origin z: 26.103 Å