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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fd4 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of mosquito arylalkylamine N-Acetyltransferase like 5b | ||||||
![]() | arylalkylamine N-Acetyltransferase like 5b | ||||||
![]() | TRANSFERASE / GNAT | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Han, Q. / Robinson, R. / Li, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Evolution of insect arylalkylamine N-acetyltransferases: structural evidence from the yellow fever mosquito, Aedes aegypti. 著者: Han, Q. / Robinson, H. / Ding, H. / Christensen, B.M. / Li, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 98.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 76.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 445.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 450.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24222.908 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: Liverpool / 遺伝子: AAEL004827, AaeL_AAEL004827 / プラスミド: PTYB / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-GOL / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.72 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: 25.5% polyethylene glycol 4000, and 17% glycerol, 0.1 m sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2011年3月18日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.075 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.95→41.18 Å / 冗長度: 11.8 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 21 |
反射 シェル | 解像度: 1.95→2.02 Å / 冗長度: 10.9 % / Rmerge(I) obs: 0.71 / Mean I/σ(I) obs: 4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: aaNAT2 from Aedes aegypti 解像度: 1.95→41.18 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.956 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.943 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.201 / ESU R Free: 0.175 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 33.376 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.95→41.18 Å
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拘束条件 |
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Refine LS restraints NCS | Dom-ID: 1 / Ens-ID: 1 / 数: 1666 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.946→1.997 Å / Total num. of bins used: 20
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