分子量: 590.652 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: N-terminal of the synthetic peptide corresponding to p1-p6 cleavage site 由来: (合成) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
#3: タンパク質・ペプチド
Cterminalproductofsubstratep1-p6
分子量: 600.688 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: C-terminal of the synthetic peptide corresponding to p1-p6 cleavage site 由来: (合成) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
解像度: 1.85→50 Å / Num. obs: 16269 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 6.4 % / Rmerge(I) obs: 0.068 / Χ2: 1.062 / Net I/σ(I): 11.9
反射 シェル
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
Diffraction-ID
% possible all
1.85-1.92
6.6
0.384
1589
1.099
1
100
1.92-1.99
6.6
0.269
1607
1.075
1
100
1.99-2.08
6.5
0.193
1599
1.068
1
100
2.08-2.19
6.5
0.159
1597
1.042
1
100
2.19-2.33
6.5
0.124
1609
1.087
1
100
2.33-2.51
6.5
0.103
1615
1.057
1
100
2.51-2.76
6.5
0.078
1634
1.045
1
100
2.76-3.16
6.4
0.065
1631
1.027
1
99.9
3.16-3.99
6.2
0.056
1657
1.053
1
99.8
3.99-50
5.8
0.032
1731
1.066
1
97.9
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
DENZO
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
PHASER
位相決定
REFMAC
精密化
PDB_EXTRACT
3.11
データ抽出
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.85→42.47 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.961 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.953 / WRfactor Rfree: 0.1981 / WRfactor Rwork: 0.1691 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / FOM work R set: 0.8926 / SU B: 4.831 / SU ML: 0.074 / SU R Cruickshank DPI: 0.1387 / SU Rfree: 0.122 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.139 / ESU R Free: 0.122 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.1956
810
5 %
RANDOM
Rwork
0.1671
-
-
-
obs
0.1685
16148
99.28 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK