PDB-4f1e: The Crystal Structure of a Human MitoNEET mutant with Asp 67 repl...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4f1e

タイトル

The Crystal Structure of a Human MitoNEET mutant with Asp 67 replaced by a Gly

要素

CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

キーワード

METAL BINDING PROTEIN / ZINC Finger CDGSH-Type domain 1 / mitochondrial outer membrane

機能・相同性

機能・相同性情報

cysteine transaminase / L-cysteine transaminase activity / protein maturation by [2Fe-2S] cluster transfer / regulation of cellular respiration / regulation of autophagy / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / pyridoxal phosphate binding / mitochondrial outer membrane / protein homodimerization activity / mitochondrion ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Baxter, E.I. / Zuris, J.A. / Wang, C. / Axelrod, H.L. / Cohen, A.E. / Paddock, M.L. / Nechushtai, R. / Onuchic, J.N. / Jennings, P.A.

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2013
タイトル: Allosteric control in a metalloprotein dramatically alters function.
著者: Baxter, E.L. / Zuris, J.A. / Wang, C. / Vo, P.L. / Axelrod, H.L. / Cohen, A.E. / Paddock, M.L. / Nechushtai, R. / Onuchic, J.N. / Jennings, P.A.

履歴

登録	2012年5月6日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年12月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年1月30日	Group: Database references
改定 1.2	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4f1e.cif.gz	478.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4f1e.ent.gz	394.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4f1e.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4f1e_validation.pdf.gz	555.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4f1e_full_validation.pdf.gz	558.8 KB	表示
XML形式データ	4f1e_validation.xml.gz	37 KB	表示
CIF形式データ	4f1e_validation.cif.gz	54.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f1/4f1e ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f1/4f1e	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4ezfC 4f28C 4f2cC 2qh7S 3ew0 3lpq S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1p90-d 1qqi-d 5fce-2 4hz1-1 3oon-d 4n0p-4 4dxz-d 4ooa-3 3haw-2 6dun-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目

#117 - 2009年9月
キサンチン酸化還元酵素 (Xanthine Oxidoreductase)
類似性 (1)
#137 - 2011年5月
シトクロムbc1 (Cytochrome bc1)
類似性 (1)
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複合体I (Complex I)
類似性 (1)
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ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (1)
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クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (1)
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シトクロムc (Cytochrome c)
類似性 (1)
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シトクロムp450 (Cytochrome p450)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

B: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

C: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

D: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

E: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

F: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

G: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

H: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

I: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

J: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

K: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

L: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

M: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

N: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

O: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

P: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

Q: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

R: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

163 kDa, 18 ポリマー
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1

A: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

B: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
18.1 kDa, 2 ポリマー
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2

C: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

D: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
18.1 kDa, 2 ポリマー
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3

E: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

F: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

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4

G: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

H: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

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18.1 kDa, 2 ポリマー
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5

I: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

J: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

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18.1 kDa, 2 ポリマー
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6

K: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

L: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

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18.1 kDa, 2 ポリマー
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7

M: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

N: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

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18.1 kDa, 2 ポリマー
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8

O: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

P: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
18.1 kDa, 2 ポリマー
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9

Q: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

R: CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
18.1 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	56.396, 110.855, 207.294
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 / MitoNEET 分子量: 8890.291 Da / 分子数: 18 / 断片: Water-soluble domain, UNP residues 33-108 / 変異: D67G / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: C10orf70, CISD1, MDS029, ZCD1 / プラスミド: pET28-a(+) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21-RIL / 参照: UniProt: Q9NZ45
#2: 化合物	ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER 分子量: 175.820 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₂S₂
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 89 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.02 Å³/Da / 溶媒含有率: 39.25 %

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRL

/ ビームライン: BL9-2 / 波長: 0.9795 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年12月16日
詳細: Double crystal monochromator Rh coated flat mirror, toroidal focusing mirror

放射

モノクロメーター: Double crystal monochromator / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9795 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.4→49.54 Å / Num. obs: 51597 / % possible obs: 99.4 % / Observed criterion σ(I): -3 / B_iso Wilson estimate: 62.343 Å² / R_merge(I) obs: 0.069 / Net I/σ(I): 15.34

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. unique obs	% possible all
2.4-2.49		0.754	1.87	19676	5070	94.8
2.49-2.58		0.615	3.05	25180	4611	99.7
2.58-2.7		0.466	4.57	34414	5260	100
2.7-2.84		0.328	6.26	33250	5058	100
2.84-3.02		0.208	9.08	34252	5199	99.9
3.02-3.25		0.122	13.53	33536	5102	100
3.25-3.58		0.07	19.99	34510	5269	100
3.58-4.09		0.05	26.57	33637	5154	100
4.09-5.14		0.044	31.48	34129	5290	99.9
	5.14	0.049	33.51	34113	5584	99.5

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

R_factor: 36.28 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO

	最高解像度	最低解像度
Rotation	3 Å	49.54 Å
Translation	3 Å	49.54 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PHASER	2.1.4	位相決定
BUSTER-TNT		精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
BUSTER	2.8.0	精密化

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ID 2QH7

2qh7

解像度: 2.4→49.54 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.9485 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.9293 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
詳細: 1. ATOM RECORD CONTAINS SUM OF TLS AND RESIDUAL B FACTORS. ANISOU RECORD CONTAINS SUM OF TLS AND RESIDUAL U FACTORS. 2. NCS RESTRAINTS WERE APPLIED USING BUSTER'S LSSR RESTRAINT REPRESENTATION (-AUTONCS). .

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2272	2624	5.09 %	RANDOM
R_work	0.1933	-	-	-
obs	0.195	51524	-	-

原子変位パラメータ

B_iso max: 177.23 Å² / B_iso mean: 74.0283 Å² / B_iso min: 30.13 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	6.748 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	7.8559 Å²	0 Å²
3-	-	-	-14.6039 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→49.54 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9078	0	72	89	9239

拘束条件

Refine-ID	タイプ	数	Restraint function	Weight	Dev ideal
X-RAY DIFFRACTION	t_dihedral_angle_d	4387	SINUSOIDAL	8
X-RAY DIFFRACTION	t_trig_c_planes	233	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_gen_planes	1346	HARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_it	9369	HARMONIC	20
X-RAY DIFFRACTION	t_nbd	9	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_improper_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_pseud_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_chiral_improper_torsion	1197	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_sum_occupancies
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_distance
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_ideal_dist_contact	10380	SEMIHARMONIC	4
X-RAY DIFFRACTION	t_bond_d	9369	HARMONIC	2	0.01
X-RAY DIFFRACTION	t_angle_deg	12574	HARMONIC	2	1.14
X-RAY DIFFRACTION	t_omega_torsion				3.56
X-RAY DIFFRACTION	t_other_torsion				1.82

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.46 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2434	177	4.99 %
R_work	0.2419	3370	-
all	0.2419	3547	-

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	7.0839	-0.911	-0.1023	4.4558	0.0536	1.4449	0.0372	0.0204	0.5535	-0.3295	-0.0513	-0.1214	-0.1493	0.3316	0.0141	-0.0699	0.0596	0.001	-0.112	-0.0004	0.0753	0.4818	7.9452	12.0562
2	6.4318	-1.9368	-0.0504	3.2086	-0.6045	1.6296	-0.0605	-0.4703	0.281	0.2697	0.1357	-0.1207	-0.3042	0.2589	-0.0752	-0.0737	0.0794	0.0006	-0.0572	-0.0751	0.0391	0.3125	5.2606	21.5835
3	1.8901	1.0553	-0.7829	5.2955	0.0987	3.1458	0.1476	-0.3372	-0.0458	0.5858	-0.2883	-0.3128	-0.0101	0.1762	0.1407	0.1132	-0.2864	-0.1499	-0.1657	0.0293	-0.0082	-17.1261	-19.805	-6.0871
4	3.1095	1.8251	-1.6137	5.4929	-1.4188	3.1167	0.0199	0.0421	0.5654	0.3496	-0.1625	0.6603	0.0615	-0.1073	0.1427	-0.032	-0.1988	0.0297	-0.2277	-0.0416	0.1869	-25.4591	-17.6267	-10.6694
5	8.2751	-1.6599	1.256	2.5588	-0.2973	1.7122	0.0274	-0.2404	-0.1948	-0.1662	-0.0144	0.0723	0.0201	0.2011	-0.013	-0.2223	-0.0415	0.0981	0.1825	0.0064	-0.1189	-37.0995	-0.4489	43.4797
6	5.814	-1.3447	1.3101	1.0659	0.2506	2.7821	-0.043	0.0575	0.3779	-0.3037	0.0798	-0.105	-0.0452	0.3141	-0.0368	-0.205	-0.1233	0.061	0.175	-0.0051	-0.0668	-31.3279	6.9123	40.1488
7	3.5316	-0.1559	-1.5913	3.2112	-0.7533	4.2612	-0.0464	-0.3309	0.0959	0.3743	0.1482	-0.234	-0.0944	-0.1236	-0.1019	0.1639	0.2949	0.1258	-0.2501	0.043	-0.0013	-27.5137	40.2678	26.9543
8	3.41	-0.0451	-0.743	4.1522	-1.4176	4.504	-0.0305	-0.1795	-0.2875	0.048	0.0161	0.4407	0.0277	-0.1913	0.0144	0.0878	0.2964	0.2874	-0.2486	0.1482	0.0652	-33.4959	35.0653	21.0585
9	4.1735	0.3911	0.1874	4.9842	-0.6089	1.457	0.0009	-0.092	-0.2224	-0.0142	-0.2157	-0.4071	-0.0764	0.2616	0.2148	-0.0699	-0.1759	-0.094	-0.1866	0.0847	0.1711	-1.072	-11.225	-14.9288
10	2.9463	0.1059	-0.2275	4.4329	-0.1495	2.0789	-0.0771	-0.0148	-0.1038	-0.26	-0.08	-0.4988	-0.1318	0.1821	0.1571	-0.0803	-0.2353	-0.0519	-0.1451	0.0997	0.1566	3.1563	-3.6708	-19.7035
11	3.6356	0.1559	-1.7653	7.7393	-0.8695	1.851	-0.0822	-0.0535	-0.3374	0.5885	0.1148	0.6455	0.0489	0.0213	-0.0327	-0.02	0.1931	0.1121	-0.2261	0.0726	0.0914	-3.55	-23.0049	22.499
12	1.0383	-0.0056	-1.1272	5.2962	0.1123	3.2426	-0.1069	-0.0872	-0.0365	0.7939	0.1989	0.3838	0.0136	0.0867	-0.092	0.0786	0.2623	0.1205	-0.1566	0.0807	0.0104	-3.81	-13.4087	25.6066
13	2.3995	-0.8665	1.255	5.0653	-1.4171	3.2319	0.1493	0.3166	-0.0131	-0.4024	-0.1312	-0.0255	-0.1139	-0.0463	-0.0181	0.027	0.2774	0.0926	-0.2053	-0.0006	0.1155	-16.1896	16.9316	6.3506
14	2.3735	-1.6476	-0.393	5.0108	-0.7087	1.3974	0.1217	0.2112	-0.084	-0.2988	-0.1571	0.403	-0.2345	-0.1306	0.0355	-0.0233	0.2292	0.0281	-0.2143	-0.0202	0.1561	-24.1826	22.7029	8.1726
15	4.6262	-3.9732	-2.2449	1.4439	-0.1388	2.2626	-0.1346	-0.244	0.5075	0.0027	-0.0377	-0.1049	-0.1777	-0.026	0.1723	-0.3258	-0.0338	-0.1679	0.1327	-0.2285	0.2267	-18.4287	13.4149	52.5095
16	5.1703	1.105	-1.9366	1.7305	1.0704	1.0357	-0.1058	-0.3469	0.3124	0.1223	-0.0423	-0.2326	-0.1549	-0.0419	0.1481	-0.4478	0.0447	-0.171	0.4609	-0.2853	0.0748	-12.5279	13.2519	60.943
17	3.8429	3.0594	-1.5779	1.7979	1.3862	4.6584	-0.1298	-0.4871	-0.249	0.2609	0.0894	0.2036	0.1772	0.0567	0.0405	-0.4284	0.103	0.1287	0.4747	0.1362	-0.2151	0.1709	-0.7549	60.1689
18	2.6908	0.0015	2.2279	2.8777	-0.3117	1.4722	-0.0838	-0.2565	-0.3086	0.0879	0.0102	0.0126	0.1731	0.2176	0.0735	-0.3462	0.1001	0.2651	0.2404	0.2063	0.1485	5.9814	-7.5797	55.3607

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	{ A\|42-106 }
2	X-RAY DIFFRACTION	2	{ B\|43-107 }
3	X-RAY DIFFRACTION	3	{ C\|42-107 }
4	X-RAY DIFFRACTION	4	{ D\|43-107 }
5	X-RAY DIFFRACTION	5	{ E\|42-106 }
6	X-RAY DIFFRACTION	6	{ F\|42-106 }
7	X-RAY DIFFRACTION	7	{ G\|42-107 }
8	X-RAY DIFFRACTION	8	{ H\|43-108 }
9	X-RAY DIFFRACTION	9	{ I\|42-106 }
10	X-RAY DIFFRACTION	10	{ J\|41-106 }
11	X-RAY DIFFRACTION	11	{ K\|42-107 }
12	X-RAY DIFFRACTION	12	{ L\|43-106 }
13	X-RAY DIFFRACTION	13	{ M\|42-106 }
14	X-RAY DIFFRACTION	14	{ N\|42-106 }
15	X-RAY DIFFRACTION	15	{ O\|46-107 }
16	X-RAY DIFFRACTION	16	{ P\|44-106 }
17	X-RAY DIFFRACTION	17	{ Q\|44-107 }
18	X-RAY DIFFRACTION	18	{ R\|44-107 }

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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