登録情報 | データベース: PDB / ID: 4f0p |
---|
タイトル | MspJI Restriction Endonuclease - P31 Form |
---|
要素 | Restriction endonuclease |
---|
キーワード | HYDROLASE / ENDONUCLEASE / DNA METHYLATION DEPENDENT / SRA DOMAIN / EPIGENETICS TOOL / CYTOSINE METHYLATION-DEPENDENT ENDONUCLEASE |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA restriction-modification system / endonuclease activity / DNA binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 PUA domain-like - #20 / Restriction endonuclease AspBHI, N-terminal / Restriction endonuclease AspBHI N-terminal / Restriction endonuclease type IV, Mrr / Restriction endonuclease / PUA domain-like / Trna Endonuclease; Chain: A, domain 1 - #10 / Trna Endonuclease; Chain: A, domain 1 / tRNA endonuclease-like domain superfamily / Roll ...PUA domain-like - #20 / Restriction endonuclease AspBHI, N-terminal / Restriction endonuclease AspBHI N-terminal / Restriction endonuclease type IV, Mrr / Restriction endonuclease / PUA domain-like / Trna Endonuclease; Chain: A, domain 1 - #10 / Trna Endonuclease; Chain: A, domain 1 / tRNA endonuclease-like domain superfamily / Roll / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Restriction endonuclease / Restriction endonuclease類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Mycobacterium sp. (バクテリア) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / AB INITIO PHASING / 解像度: 2.79 Å |
---|
データ登録者 | Horton, J.R. / Mabuchi, M. / Cohen-Karni, D. / Zhang, X. / Griggs, R. / Samaranayake, M. / Roberts, R.J. / Zheng, Y. / Cheng, X. |
---|
引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2012 タイトル: Structure and cleavage activity of the tetrameric MspJI DNA modification-dependent restriction endonuclease. 著者: Horton, J.R. / Mabuchi, M.Y. / Cohen-Karni, D. / Zhang, X. / Griggs, R.M. / Samaranayake, M. / Roberts, R.J. / Zheng, Y. / Cheng, X. |
---|
履歴 | 登録 | 2012年5月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2012年8月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2012年8月15日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2012年11月7日 | Group: Database references |
---|
改定 1.3 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.4 | 2024年4月3日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|