+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4eng | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | STRUCTURE OF ENDOGLUCANASE V CELLOHEXAOSE COMPLEX | |||||||||
要素 | ENDOGLUCANASE V CELLOHEXAOSE COMPLEX | |||||||||
キーワード | GLYCOSYL HYDROLASE / HYDROLASE / ENDOGLUCANASE | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Humicola insolens (菌類) | |||||||||
手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.9 Å | |||||||||
データ登録者 | Davies, G.J. / Schulein, M. | |||||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1996 タイトル: Structure determination and refinement of the Humicola insolens endoglucanase V at 1.5 A resolution. 著者: Davies, G.J. / Dodson, G. / Moore, M.H. / Tolley, S.P. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. / Rasmussen, G. / Schulein, M. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Structures of Oligosaccharide-Bound Forms of the Endoglucanase V from Humicola Insolens at 1.9 A Resolution 著者: Davies, G.J. / Tolley, S.P. / Henrissat, B. / Hjort, C. / Schulein, M. #2: ジャーナル: Nature / 年: 1993 タイトル: Structure and Function of Endoglucanase V 著者: Davies, G.J. / Dodson, G.G. / Hubbard, R.E. / Tolley, S.P. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. / Hjort, C. / Mikkelsen, J.M. / Rasmussen, G. / Schulein, M. | |||||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 4eng.cif.gz | 54.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb4eng.ent.gz | 40.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 4eng.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/en/4eng ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/en/4eng | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 22544.984 Da / 分子数: 1 / 断片: CATALYTIC CORE, RESIDUES 1 - 210 / 変異: D10N / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Humicola insolens (菌類) / 参照: UniProt: P43316, cellulase | ||||
---|---|---|---|---|---|
#2: 多糖 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | THIS IS AN INACTIVE MUTANT (D10N) COMPLEX WITH THE SUBSTRATE CELLOHEXAOSE. TWO HALF CELLOHEXAOSES ...THIS IS AN INACTIVE MUTANT (D10N) COMPLEX WITH THE SUBSTRATE CELLOHEXAO | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.01 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.83 % | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | pH: 8 詳細: 10MG/ML ENZYME IN 20MM TRIS-HCL BUFFER PH 8.0. PRECIPITANT 18%(W/V) PEG 8K. CO-CRYSTALLISED WITH 5MM CELLOHEXAOSE | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Davies, G.J., (1993) Nature, 365, 362. | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
---|---|
放射光源 | 由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU RUH2R / 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1993 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→20 Å / Num. obs: 13502 / % possible obs: 95.1 % / Observed criterion σ(I): -999 / 冗長度: 3.2 % / Rmerge(I) obs: 0.085 / Net I/σ(I): 12.56 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→2 Å / 冗長度: 1.4 % / Rmerge(I) obs: 0.157 / Mean I/σ(I) obs: 4.48 / % possible all: 64 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: PDB ENTRY 2ENG 解像度: 1.9→10 Å /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→10 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|