ソフトウェア 名称 バージョン 分類 NB SCALEPACKデータスケーリング Show BUSTER-TNT精密化 Show PDB_EXTRACT3.11 データ抽出 Show ADSCQuantumデータ収集 DENZOデータ削減 BUSTER2.8.0位相決定 BUSTER2.8.0精密化
精密化 構造決定の手法 : 分子置換 / 解像度 : 1.95→46.13 Å / Cor.coef. Fo :Fc : 0.9558 / Cor.coef. Fo :Fc free : 0.9336 / Occupancy max : 1 / Occupancy min : 0.11 / SU R Cruickshank DPI : 0.125 / 交差検証法 : THROUGHOUT / σ(F) : 0 / 立体化学のターゲット値 : Engh & HuberRfactor 反射数 %反射 Selection details Rfree 0.2024 998 5.34 % RANDOM Rwork 0.1603 - - - obs 0.1624 18682 - -
原子変位パラメータ Biso max : 123.86 Å2 / Biso mean : 29.9421 Å2 / Biso min : 14.23 Å2 Baniso -1 Baniso -2 Baniso -3 1- -3.0078 Å2 0 Å2 0 Å2 2- - -3.0078 Å2 0 Å2 3- - - 6.0156 Å2
Refine analyze Luzzati coordinate error obs : 0.18 Å精密化ステップ サイクル : LAST / 解像度 : 1.95→46.13 Åタンパク質 核酸 リガンド 溶媒 全体 原子数 1552 0 10 200 1762
拘束条件 大きな表を表示 (6 x 17) 大きな表を隠す Refine-ID タイプ 数 Restraint function Weight Dev ideal X-RAY DIFFRACTION t_dihedral_angle_d557 SINUSOIDAL2 X-RAY DIFFRACTION t_trig_c_planes37 HARMONIC2 X-RAY DIFFRACTION t_gen_planes243 HARMONIC5 X-RAY DIFFRACTION t_it1664 HARMONIC20 X-RAY DIFFRACTION t_nbdX-RAY DIFFRACTION t_improper_torsionX-RAY DIFFRACTION t_pseud_angleX-RAY DIFFRACTION t_chiral_improper_torsion225 SEMIHARMONIC5 X-RAY DIFFRACTION t_sum_occupanciesX-RAY DIFFRACTION t_utility_distanceX-RAY DIFFRACTION t_utility_angleX-RAY DIFFRACTION t_utility_torsionX-RAY DIFFRACTION t_ideal_dist_contact2011 SEMIHARMONIC4 X-RAY DIFFRACTION t_bond_d1664 HARMONIC2 0.01 X-RAY DIFFRACTION t_angle_deg2265 HARMONIC2 1.07 X-RAY DIFFRACTION t_omega_torsion4.13 X-RAY DIFFRACTION t_other_torsion17.03
LS精密化 シェル 解像度 : 1.95→2.07 Å / Total num. of bins used : 9 Rfactor 反射数 %反射 Rfree 0.2222 130 5.6 % Rwork 0.1899 2192 - all 0.1918 2322 -