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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4dnc | ||||||
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タイトル | Crystal structure of human MOF in complex with MSL1 | ||||||
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![]() | TRANSCRIPTION / histone acetyltransferase / MOF / MSL / NSL | ||||||
機能・相同性 | ![]() positive regulation of skeletal muscle satellite cell differentiation / regulation of mitochondrial transcription / MSL complex / protein propionyltransferase activity / histone H4 acetyltransferase activity / regulation of mRNA processing / dosage compensation by inactivation of X chromosome / post-embryonic hemopoiesis / myeloid cell differentiation / NSL complex ...positive regulation of skeletal muscle satellite cell differentiation / regulation of mitochondrial transcription / MSL complex / protein propionyltransferase activity / histone H4 acetyltransferase activity / regulation of mRNA processing / dosage compensation by inactivation of X chromosome / post-embryonic hemopoiesis / myeloid cell differentiation / NSL complex / negative regulation of epithelial to mesenchymal transition / protein-lysine-acetyltransferase activity / negative regulation of type I interferon production / oogenesis / Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes / NuA4 histone acetyltransferase complex / MLL1 complex / histone acetyltransferase complex / histone H2AK5 acetyltransferase activity / histone H2AK9 acetyltransferase activity / histone H2BK5 acetyltransferase activity / histone H2BK12 acetyltransferase activity / histone H3K36 acetyltransferase activity / histone H3K4 acetyltransferase activity / histone H3K56 acetyltransferase activity / histone H4K16 acetyltransferase activity / histone H3K23 acetyltransferase activity / histone H4K5 acetyltransferase activity / histone H4K8 acetyltransferase activity / histone H4K12 acetyltransferase activity / histone H3K14 acetyltransferase activity / histone H3K9 acetyltransferase activity / histone H3K122 acetyltransferase activity / histone H3K18 acetyltransferase activity / histone H3K27 acetyltransferase activity / positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II / histone acetyltransferase / neurogenesis / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基以外のアシル基を移すもの / transcription initiation-coupled chromatin remodeling / promoter-specific chromatin binding / kinetochore / nuclear matrix / HATs acetylate histones / chromosome / protein-macromolecule adaptor activity / RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding / transcription coactivator activity / regulation of autophagy / nuclear speck / chromatin remodeling / negative regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of DNA-templated transcription / enzyme binding / mitochondrion / zinc ion binding / nucleoplasm / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Huang, J. / Lei, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insight into the regulation of MOF in the male-specific lethal complex and the non-specific lethal complex. 著者: Huang, J. / Wan, B. / Wu, L. / Yang, Y. / Dou, Y. / Lei, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 144 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 112.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 453.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 465.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 29 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 38.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 33983.344 Da / 分子数: 2 / 断片: HAT domain (UNP residues 170-458) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5764.471 Da / 分子数: 2 / 断片: MOF-binding motif (UNP residues 473-520) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.83 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.56 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 1.6 M Li2SO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年3月20日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.98159 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.05→100 Å / Num. obs: 54362 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 43.572 Å2 / ksol: 0.388 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.05→40.994 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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