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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4c9h | ||||||
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タイトル | Structure of yeast mitochondrial ADP/ATP carrier isoform 2 inhibited by carboxyatractyloside (P212121 crystal form) | ||||||
![]() | ADP, ATP CARRIER PROTEIN 2 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / MITOCHONDRIAL CARRIER / ADP/ATP CARRIER | ||||||
機能・相同性 | ![]() Mitochondrial Uncoupling / Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane / ADP transport / mitochondrial ADP transmembrane transport / Mitochondrial protein import / ATP:ADP antiporter activity / mitochondrial ATP transmembrane transport / heme transport / ATP transport / Mitochondrial protein degradation ...Mitochondrial Uncoupling / Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane / ADP transport / mitochondrial ADP transmembrane transport / Mitochondrial protein import / ATP:ADP antiporter activity / mitochondrial ATP transmembrane transport / heme transport / ATP transport / Mitochondrial protein degradation / cardiolipin binding / anaerobic respiration / peroxisomal membrane / mitochondrial transport / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / aerobic respiration / transmembrane transport / mitochondrial inner membrane / apoptotic process / mitochondrion / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ruprecht, J.J. / Hellawell, A.M. / Harding, M. / Crichton, P.G. / McCoy, A.J. / Kunji, E.R.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structures of Yeast Mitochondrial Adp/ATP Carriers Support a Domain-Based Alternating-Access Transport Mechanism 著者: Ruprecht, J.J. / Hellawell, A.M. / Harding, M. / Crichton, P.G. / Mccoy, A.J. / Kunji, E.R.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 128.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 96.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 2.3 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 2.3 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 30.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.9944, -0.1053, 0.0018), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34468.164 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PYES3 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-CDL / #4: 化合物 | ChemComp-CM5 / | 非ポリマーの詳細 | CARDIOLIPI | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.5 % / 解説: NONE |
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結晶化 | pH: 8.5 詳細: 0.1M TRIS PH 8.5, 10MM SODIUM CITRATE, 50MM AMMONIUM SULFATE, 8% T-BUTANOL, 23.5% PEG600. |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2011年2月27日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.8726 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.2→19.84 Å / Num. obs: 11939 / % possible obs: 99.5 % / Observed criterion σ(I): 6 / 冗長度: 3.6 % / Biso Wilson estimate: 47.01 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.19 / Net I/σ(I): 6.9 |
反射 シェル | 解像度: 3.2→3.46 Å / 冗長度: 3.7 % / Rmerge(I) obs: 0.61 / Mean I/σ(I) obs: 2.4 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 4C9G 解像度: 3.2→19.839 Å / SU ML: 0.44 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 28.84 / 立体化学のターゲット値: ML
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.2→19.839 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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